Det meste av Alaska er omgitt av vann. I henholdsvis nord og nordvest er to vannmasser i Alaska, Beauforthavet og Chukchihavet, som begge smelter sammen i Polhavet. Mot sørøst ligger Alaska-gulfen, som smelter inn i Stillehavet. Beringshavet ligger i sørvest.
Ishavet
Ishavet er det minste av alle havene. Den ligger nesten helt over polarsirkelen og er ekstremt kald og dekket av is mesteparten av tiden. Den er delt inn i to bassenger, det Eurasiske bassenget og det nordamerikanske bassenget, av Lomonosov-ryggen. Uttakene for dette havet er Beringstredet, mellom Alaska og Russland; Davis-stredet, mellom Grønland og Canada; og Danmarksstredet og Norskehavet, mellom Grønland og Europa. Dette havet er hjem for fisk, sel, hvalross og hval på grunn av den lave temperaturen. Senteret til dette havet er dekket av en gjennomsnittlig 10 fot tykk polar ispakke som strekker seg utover i vintermånedene, dobler i størrelse og strekker seg til å omslutte landmasser. Åpent hav omgir ispakken i sommermånedene, men den forsvinner aldri helt.
Stillehavet
Stillehavet er det største av alle hav. Den dekker omtrent 28 prosent av den globale overflaten og er 15 ganger størrelsen på USA. Om vinteren dannes havis, og mange skip utsettes også for ising fra oktober til mai. Stillehavet er hjemmet til marine livsformer som sjøløver, sjøaure, sel, skilpadder og hvaler. Økonomisk tilbyr Stillehavet tilgjengelig, relativt billig sjøtransport, omfattende fiskeplasser, offshore olje og gass åker, mineraler og sand og grus for byggenæringen og mer enn 60 prosent av verdens fisk kommer fra Stillehavet Hav.
Gulf of Alaska
Alaskastrømmen og Alaskas kyststrøm tar over Alaskabukten. Disse strømningene fungerer som veier for organismer og ressursene de er avhengige av. Noen få innløp, som Cook Inlet og Prince William Sound, beskytter organismer mot sterke strømmer. Denne bukten inneholder mange store isbreer og isfjell som bæres til sjøs av de sterke strømningene.
Beringshavet
Beringshavet er et av de største marine økosystemene i verden. Det er mellom Sibir og Alaska. Mot nord er det forbundet med Chukchihavet og Ishavet ved Beringstredet; Stillehavet ligger sør for Beringhavet, forbi Aleutian Islands og Alaska-halvøya som øyene strekker seg fra.
Beringshavet er hjemsted for mange store fugler og marine dyr, som pelssel og hval. Havets temperatur økte de siste 50 årene, og reduserte visse fisk og havdyrpopulasjoner. Dette bekymrer folk i fiskeindustrien, siden dette havet har vært en av de viktigste kildene til fisk.
Beaufort Sea
Beaufort-havet ligger nord for Alaska i Polhavet. Den ble oppkalt etter den britiske bakadmiralen Sir Francis Beaufort. Sjøen dekker ca 184.000 kvadratkilometer og den gjennomsnittlige dybden er 3.239 fot, men den stuper så langt ned som 15.360 fot ned. Sjøen er frossen fast i det sentrale og nordlige området med kystens icepack åpning i august og september. Hval og sjøfugl er to av de vanligste dyrene som finnes i nærheten av Alaska i Beauforthavet. I 1986 ble det funnet mange petroleumsreserver i Alaskas Prudhoe Bay, som ligger i dette havet.
Chukchi Sea
Chukchi-havet ligger også innenfor Ishavet, nordvest for Alaska. Dette havet inneholder et grunt gulv som gir næringsstoffer og habitat for dyr som hvalross, issel, hval, sjøfugl og isbjørn. Dette havet er hjemmet til en tidel av verdens befolkning av isbjørner. Det skiftende klimaet, som får temperaturen til å stige, påvirker populasjonen av isbjørner, fordi den smeltende isen gjør det vanskeligere for dem å jakte på mat. Ettersom havisen fortsetter å smelte, er mange olje- og gasselskaper interessert i å bore i det spesifikke området.