Mennesker stoler på økosystemer for å levere mat og andre nødvendigheter for et sunt menneskeliv. Visse menneskelige aktiviteter har imidlertid hatt en ødeleggende innvirkning på økosystemene. Fra forurensning til overhøsting har skader og utnyttelse av dyrelivet og naturlig vegetasjon av mennesker gitt noen økosystemer i dårlig form.
Økosystemforurensning
Mange biprodukter fra industrialisering har skadet økosystemene. For eksempel brenner kull for å produsere energi, frigjør kjemikalier som svoveldioksid. Slike kjemikalier i luften fører til surt regn og syreavsetning, noe som kan skade plante- og dyreliv, spesielt ettersom det forsurer vannøkosystemene. I tillegg kan flytende kjemisk avrenning fra menneskelige aktiviteter påvirke økosystemene negativt. Slik avrenning produseres ikke bare av store industrifabrikker. Sink- og blyavrenning fra plener, innkjørsler og fortau i boligområder kan skade økosystemene.
Byspredning
Urban sprawl er den stadig økende spredningen av byer ut i tidligere landlige områder. Rydding og avskoging har skjedd for å imøtekomme skyvet av urbanisering i landlige regioner. Foruten å resultere i tap av skog og annen vegetasjon, fører slike aktive til fragmentering av habitat. Når veier, hjem eller til og med kjøretøy skjærer gjennom den opprinnelige økosystemsammensetningen, kan dyr bli avskåret fra en stor del av deres habitat og, i utvidelse, befolkningen.
Introduksjon av invasive arter
Overføring av arter kan være uvitende, for eksempel en plantespore som trekker en tur på en sko. Eller introduksjonen av en ny art kan være med vilje, slik tilfellet var med den asiatiske karpen i USA. Ifølge National Wildlife Federation er 42 prosent av truede dyr truet av ikke-innfødte arter. Disse artene utgjør et problem fordi de konkurrerer om mat og kanskje ikke fungerer som god mat for de innfødte artene. I tillegg kan invasive arter redusere det biologiske mangfoldet og endre økosystemet fysisk. For eksempel kan en invasiv art endre jordens kjemiske sammensetning.
Overhøsting av økosystemer
Overhøsting, noen ganger kalt overutnyttelse, skjer når arter er hentet fra deres naturlige habitat. Dette kan skje som et resultat av ødeleggelse av habitater, men oftere er det et resultat av jakt eller fiske. Slike uholdbare aktiviteter kan særlig sees i fiskeindustrien, der arter som torsk, hyse og flyndre har fått redusert bestandene drastisk. Overhøsting kan føre til ubalanse i økosystemer, forstyrre næringskjeden og skade andre ikke-høstede arter.