DNAサンプルをアガロースゲルで泳動して写真を撮ったら、後で使用するために写真を保存できます。その時点で、結果を分析して解釈することができます。 あなたが探しているものの種類はあなたの実験の性質に依存します。 たとえば、DNAフィンガープリントを作成している場合は、容疑者と犯罪現場のサンプルの2つのサンプルのDNA断片のサイズを比較する必要があります。 対照的に、細菌由来のプラスミドを使用している場合は、プラスミドにインサートが含まれていることを確認する必要があります。 したがって、ゲルをどのように解釈するかは、行った実験に一部依存します。 それでも、適用できる一般的なルールがいくつかあります。
このセクションの手順を使用する必要がある場合とない場合があることに注意してください。 アガロースゲル電気泳動は、プラスミドに特定のインサートが含まれていることを確認するためによく使用されます。 プラスミドを使用していない場合は、このセクションをスキップできます。 ただし、そうであれば、これらの指示に従うことができます。
カットされていないプラスミドまたはニックの入ったプラスミドを使用している場合、上記のセクション1の手順を使用してサイズを推定することはできないことに注意してください。 これは、切断されていないプラスミドとニックの入ったプラスミドが線状DNAとは異なる速度で移動するためです。
各レーンのバンド数を比較します。 制限酵素は、制限部位と呼ばれる特定の配列が発生する部位でDNAを切断することを思い出してください。 サンプルを2つの制限酵素で処理した場合、インサートのバンドとプラスミドの残りのバンドの両方が存在するはずです。 これは、インサートにそれぞれ異なる酵素の2つの制限部位が隣接しているため、これらの両方の部位を切断すると、インサートがプラスミドから解放されるためです。 対照的に、1つの部位のみを切断すると、プラスミドが線状DNAに変換されます。 したがって、制限酵素なしまたは1つの制限酵素を使用してカットしたサンプルは単一のバンドを特徴とし、2つの制限酵素を使用してカットしたサンプルは2つのバンドを特徴とする必要があります。
ニックの入ったプラスミドDNAによって作成されたバンドに注意してください。 ニックの入ったプラスミドは一本鎖にのみ切断されているため、切断されたプラスミドよりもゆっくりと移動します。 切断されたプラスミドは、切断されていないDNAよりもゆっくりと移動します。
セクション1で説明されている手順を使用してインサートのサイズを見積もり、それが期待に一致するかどうかを判断します（これは実験によって異なります）。
必要なもの
- 鉛筆
- 論文
- スプレッドシートプログラム
- あなたのゲルの写真
- ルーラー