המילה מאובנים מגיעה מהמונח הלטיני fossilis, שפירושו "נחפר". מאובנים נוצרים כאשר אורגניזם נקבר על ידי מים המכילים פסולת ומינרלים, ודרך השפעות רוח או כוח משיכה. רוב המאובנים נמצאים בסלעי משקע. ניתן למצוא מאובנים גם בסלע מטמורפי, או בסלע שהשתנה על ידי חום או לחץ. לעיתים רחוקות נמצאים מאובנים בסלע דמיוני שנוצר כאשר מגמה זורמת ומתקשה. חמשת סוגי המאובנים המצוטטים לרוב הם עובש, יצוק, חותם, מינרלי מאובנים ועקבות.
עובש או רושם
עובש או מאובן רושם נוצר כאשר הצמח או החיה מתפוררים לחלוטין אך מותירים אחריהם רושם של עצמו, כמו תבנית חלולה. אין חומר אורגני ואין האורגניזם מועתק. מאובנים של עובש או רושם יכולים להיווצר בכמה דרכים, אך באופן כללי חייב להיות נוכח מספיק אוויר כדי לאפשר לחומר האורגני להתפרק לחלוטין, מה שמונע מאובנים או את האורגניזם. מאובנים אלו נוצרים בדרך כלל בחול או חימר.
ללהק
מאובנים יצוקים הם הסוג שאנשים מכירים ביותר, שכן הם מרכיבים את שלדי הדינוזאורים המרהיבים המוצגים במוזיאונים. מאובנים יצוקים מתרחשים כאשר מינרלים משקעים בתבנית שהותיר החומר האורגני הנרקב, וכתוצאה מכך העתק תלת מימדי של המבנים הקשים של הצמח או החיה.
חוֹתָם
מאובני טביעה נמצאים בסחף או חימר, כמו מאובני עובש או רושם, אך הם משאירים אחריהם חותם דו מימדי בלבד. לעיתים מאובנים אלו נמצאים על משטחי סלע חשופים או כאשר השכבות בסלע נשברות, וחושפות את המאובן שבתוכו.
מינרליזציה
במאובנים מיובשים, או מאובנים, כל חלק באורגניזם מוחלף במינרלים, ומשאיר עותק אבן של האורגניזם. עצות, שיניים ואפילו חומרי צמחים עציים כגון עצים נשמרים לעתים בצורה זו. אחת הדוגמאות המפורסמות להתאבנות היא מאות העצים המאובנים ביער המאובן בהולברוק, אריזונה.
זֵכֶר
מאובני עקבות מראים בדרך כלל מסלולים שחיות יצרו תוך כדי מעבר על משקעים רכים. מאוחר יותר משקע זה מתקשה להפוך לסלע משקע. מאובני עקבות הם בעלי ערך רב לפלנטולוגים מכיוון שעל ידי חקר טביעות הרגל הללו מדענים יכולים לגלות כיצד בעלי החיים עברו, וזה בתורו נותן מידע חשוב על המבנה ואפילו על חייו מִין.