ארבעת סוגי המערכת האקולוגית הם סיווגים המכונים מלאכותיים, ארציים, עדכניים ולוטיים. מערכות אקולוגיות הן חלקים מביומים, שהם מערכות אקלים של חיים ואורגניזמים. במערכות האקולוגיות של הביום ישנם גורמים סביבתיים חיים ולא חיים המכונים ביוטי ואביוטי. גורמים ביוטיים הם אורגניזמים, צמחים ובעלי חיים, וגורמים אביוטיים הם גורמים סביבתיים שאינם חיים, כגון אור, מים או גזים במערכת.
יַבַּשׁתִי
מערכות אקולוגיות יבשות הן מערכות יבשות כגון יערות, מדבריות, שטחי עשב, טונדרה ואזורי חוף. בהתאם לאקלים של הביום, יותר ממערכת אקולוגית יבשתית יכולה להיות נוכחת. לדוגמא, לטונדרות יש פחות צמחים בגלל טמפרטורות נמוכות יותר; מדבריות מייצרים פחות צמחים בגלל טמפרטורות גבוהות יותר. ביער או באדמות עשויות להיות מגוון קיצוני של חיי צמחים מכיוון שבביו שלה יש את כמות השמש והלחות הנכונים עבור מערכות אקולוגיות ומינים רבים.
Lentic
Lentic הוא סוג של מערכות אקולוגיות מימיות שנמצאות ביבשה, כגון:
- בריכות
- נהרות
- אגמים
- ביצות
- זרמים
לרוב, מערכות אקולוגיות עדשות מתוארות כגופים דוממים של מים מתוקים, והן מערכות אקולוגיות קטנות יותר. יש מערכות אקולוגיות עדשות המכילות בעלי חיים ומיקרואורגניזמים, אך הן מסתמכות בעיקר על פוטוסינתזה של אצות וצמחים תת-מימיים כדי לייצר אנרגיה כדי לשגשג. אחת הדרישות של גוף מים עדתי היא שהוא נחשף לשמש כדי לעודד פוטוסינתזה.
לוטיק
מערכות אקולוגיות לוטיות דומות לעדניות בכך שהן חלק ממעמד המים הימיים, והחיים בהן הם תומכים דומים לאלה המצויים במערכות אקולוגיות עדשות. מערכות הלוטיקה הן גופי מים נעים שזורמים לגופי מים אחרים ובסופו של דבר לאוקיאנוס. מערכות אלו יכולות לכלול מעיינות, נהרות ונחלים, או כל גוף מים שזורם למים דמויי ים או לאוקיאנוס. שלא כמו עדשות, מערכות הלוטיקה אינן משגשגות מפוטוסינתזה ויכולות לכלול גופי מים מתוקים ומלוחים, כגון שפך בו מים מתוקים מתערבבים לזרם מים מלוחים.
מְלָאכוּתִי
למרות שמערכות אקולוגיות מלאכותיות יכולות להיכלל עם ארציים, עדניים ולוטיים, יש הסבורים כי חשוב לאיכות הסביבה לבחון מערכות מעשה ידי אדם. מערכות מעשה ידי אדם כוללות אזורים גדולים כמו חופים ויערות, ואלו קטנים כמו טרריומים, למשל. לפעמים הם נועדו לחדש את הסביבה, ופעמים אחרות הם אמורים לעזור לאנשי הסביבה ללמוד. Biodomes, לדוגמא, מערכות אקולוגיות מלאכותיות סגורות שנוצרו לחקר הביולוגיה.