Les organigrammes bactériens fournissent une aide visuelle à l'identification rapide des espèces bactériennes. Pour créer un organigramme, identifiez d'abord les caractéristiques communes des différents groupes de bactéries pour exclure les groupes non pertinents et pour déterminer plus efficacement les bactéries présentes. Une variété de logiciels ont les éléments géométriques nécessaires pour traiter un groupe à la fois, par coloration de Gram et forme. Une espèce courante de bactérie de la peau, Staphylococcus aureus, offre un excellent point de départ, chaque étape de l'organigramme étant définie dans une forme géométrique telle qu'un rectangle, ovale, carré ou boîte avec des lignes reliant chaque étape suivante en dessous pour les organigrammes alignés en portrait et horizontalement pour les organigrammes orientés paysage.
Écrivez ou tapez "Gram Stain" comme test principal et créez deux ramifications à partir de cette boîte. Marquez les ramifications "Gram Positive" et "Gram Negative". Les taches Gram-positives, telles que Staphylococcus, apparaissent pourpres et les taches Gram-négatives, telles que E. coli a l'air rouge. Les bactéries sont divisées en ces deux groupes et la coloration de Gram est le premier test effectué sur un inconnu échantillon, car il s'agit d'une procédure simple et peu coûteuse qui permet à un grand pourcentage de possibilités d'être mis au rebut.
Entrez les options suivantes dans une case ou une autre forme sur l'organigramme, qui identifie la forme des bactéries obtenues à partir de l'analyse microscopique de la coloration de Gram. Les types de formes sont des tiges, des coques, des sphères ou des ovoïdes, des spirilles, des tiges torsadées en spirale, des spirochètes, de longues tiges torsadées en spirale très fines, avec des bourgeons et des appendices et des parties filamenteuses et filiformes. Les bâtonnets et les cocci sont les plus courants. Staphylococcus s'identifie comme coccus.
Divisez les étapes suivantes, les cases ou d'autres formes de choix, en tests biochimiques pour chaque branche de l'organigramme. Ceux-ci diffèrent pour les diverses formes des groupements de Gram. Le test principal pour les cocci à Gram positif est le test de la catalase utilisant du peroxyde d'hydrogène, et les options qui en résultent sont soit catalase positive ou catalase négative. Par exemple, les espèces Micrococcus et Staphylococcus sont positives et les Streptococcus négatives. Des exemples d'autres étapes pour les groupes en dehors des non-cocci, non-Gram positifs comprennent la fermentation du lactose ou la non-fermentation pour les bâtonnets Gram-négatifs.
Analysez les propriétés de fermentation des bactéries dans l'élément suivant de l'organigramme. La bactérie fermente ou s'oxyde. Staphylococcus aureus est fermentatif contrairement au Micrococcus, qui est oxydant.
Ajoutez une autre ligne et forme à l'organigramme. Cette étape représente un test de coagulation, un test biochimique appelé coagulase. Staphylococcus aureus produit l'enzyme coagulase et, lorsqu'il est testé avec un milieu approprié, donne un caillot gélatineux. Tous les autres tests de staphylocoques sont négatifs à la coagulase.
Les étapes alternatives pour d'autres groupes de bactéries comprennent le test d'oxydase pour les bâtonnets Gram-négatifs, ou la fermentation rapide ou lente du lactose.