Situé en partie dans le nord des Andes, avec des côtes à la fois sur l'océan Pacifique et la mer des Caraïbes, La géographie unique de la Colombie crée cinq écosystèmes très distinctifs à l'intérieur de ses frontières: la toundra alpine, ou paramo; forêt tropicale; forêts de nuages de haute altitude; régions côtières; et les plaines - ou los llanos. Parce que la Colombie est si proche de l'équateur, elle ne connaît pas de variations saisonnières importantes.
Paramos
Les paramos sont des écosystèmes tropicaux de haute altitude qui commencent tout juste à être compris par la communauté scientifique. La recherche a indiqué que ces écosystèmes uniques génèrent de nouvelles espèces plus rapidement que tout autre écosystème sur Terre. Les paramos colombiens abritent 68 espèces de frailejones, des plantes à fleurs qui captent l'eau des brumes qui passent. Avec le lichen et la mousse de l'écosystème, les frailejones filtrent et régulent l'eau qui finit par descendre dans les basses altitudes de Columbia. Les paramos colombiens abritent également environ 5 000 autres espèces végétales uniques.
Forêts de nuages
Juste en dessous des paramos en altitude se trouvent les forêts de nuages de Colombie. Ces forêts sont incluses dans le parc national du pays Las Orquídeas, du nom des plus de 200 espèces d'orchidées qui s'y trouvent. Les forêts de nuages contiennent également de nombreuses autres espèces originaires de Colombie, notamment des espèces de jaguar, de puma, de singe, de cerf, d'oiseaux, de chauves-souris et d'insectes. Les forêts de nuages abritent également l'ours à lunettes en voie de disparition. Les scientifiques pensent que le changement climatique peut affecter les plantes préférées de l'ours, les obligeant à chercher de plus en plus de nourriture et les mettant éventuellement en concurrence avec d'autres espèces.
La forêt Amazonienne
Environ un tiers de la Colombie est couvert par l'Amazonie; comme le reste de la plus grande forêt tropicale du monde, cette région abrite de nombreuses espèces uniques. En 2013, des chercheurs ont révélé la découverte de deux nouvelles espèces en Amazonie colombienne: Cercosaura hypnoides et Callicebus caquetensis. Cercosaura hypnoides est un petit lézard noir considéré comme en voie de disparition et Callicebus caquetensis est l'une des 20 espèces de singes titi vivant en Amazonie. Lorsque ces singes sont des bébés, ils affichent leur contentement et leur affection en ronronnant, comme des chatons.
Régions côtières
Situées aux limites des écosystèmes aquatiques et terrestres, les régions côtières de la Colombie abritent principalement des forêts de mangroves. En raison du volume élevé de matière organique en décomposition, ces écosystèmes côtiers abritent un grand nombre de poissons. Les forêts de mangrove contiennent de nombreuses espèces de mangroves ainsi qu'une population en plein essor de bivalves marins et de mollusques; les communautés locales récoltent souvent le bivalve connu sous le nom de piangua hembra. Un certain nombre de mammifères habitent ces forêts de mangrove, notamment des chats tigres, des ragondins et des porcs sauvages connus sous le nom de « tatabro ».
Los Llanos (Plaines)
Les prairies, ou Los Llanos, se situent principalement autour du bassin de l'Orénoque, niché entre la Colombie et le Venezuela. La rivière elle-même abrite le crocodile de l'Orénoque indigène et en voie de disparition, dont la longueur est connue pour atteindre 23 pieds. La tortue de l'Orénoque, la loutre géante, le tatou géant et l'aigle noir et alezan sont d'autres espèces menacées de Los Llanos. Les plaines accueillent également de nombreux oiseaux migrateurs, comme le chevalier jaune et plusieurs espèces de bécasseaux.