Η εμφάνιση χρώματος στο μάτι ενός ατόμου είναι συνάρτηση των χρωστικών που περιλαμβάνονται στην ίριδα. Τα συγκεκριμένα χρώματα καθορίζονται από τα γονίδια του ατόμου, καθιστώντας ορισμένα χρώματα των ματιών πιο κοινά από άλλα.
Το πιο κοινό χρώμα των ματιών σε όλο τον κόσμο είναι καφέ. Μια μεγάλη ποσότητα μελανίνης, η χρωστική που προκαλεί επίσης πιο σκούρα μαλλιά και τον τόνο του δέρματος, θα προκαλέσει καφέ χρώμα ματιών. Πολύ σκοτεινά μάτια μπορεί να φαίνονται μαύρα. Τα καστανά μάτια είναι κοινά σε όλους τους αγώνες και σε όλα τα μέρη του κόσμου.
Τα λιγότερο συνηθισμένα χρώματα των ματιών περιλαμβάνουν το μπλε (βρίσκονται σε άτομα ευρωπαϊκής καταγωγής με χαμηλότερα επίπεδα μελανίνης), τη φουντουκιά (ένας συνδυασμός του πράσινου και του καφέ), του γκρι (μια παραλλαγή του μπλε που αναμιγνύεται με άλλες αποχρώσεις) και του πράσινου (συνήθως ενοποιείται για τους σκανδιναβικούς ανθρώπους προέλευση). Το πιο σπάνιο μεταξύ αυτών των χρωμάτων είναι το πράσινο με μόνο ένα έως δύο τοις εκατό όλων των ανθρώπων που γεννιούνται με φυσικά πράσινα μάτια.
Τα πιο σπάνια χρώματα των ματιών περιλαμβάνουν κεχριμπάρι, μοβ και κόκκινο. Το κεχριμπάρι είναι το αποτέλεσμα της κίτρινης χρωστικής λιποχρωμίας. Τα ιώδη μάτια πιστεύεται ότι είναι το αποτέλεσμα της έλλειψης αρκετής χρωστικής για να γεμίσει ολόκληρο το μάτι, επιτρέποντας στα αιμοφόρα αγγεία να γίνουν ορατά. Το κόκκινο, πιθανότατα το πιο σπάνιο από όλα τα ανθρώπινα χρώματα των ματιών, είναι το αποτέλεσμα του αλμπινισμού, όπου το μάτι δεν έχει χρωστική ουσία.
