Το κύριο αποτέλεσμα της καταστροφής των οικοτόπων είναι η μείωση της βιοποικιλότητας, η οποία αναφέρεται στην ποικιλία και την αφθονία διαφορετικών ειδών ζώων και φυτών σε ένα συγκεκριμένο περιβάλλον. Όταν ένα ζώο χάνει το φυσικό σπίτι ή το βιότοπο που χρειάζεται για να επιβιώσει, ο αριθμός του μειώνεται γρήγορα και κινείται προς εξαφάνιση. Εκτιμάται ότι 14.000 έως 35.000 είδη κινδυνεύουν να εξαφανιστούν και η καταστροφή των οικοτόπων είναι μία από τις κύριες αιτίες.
Γονιμοποίηση και διασπορά σπόρων
Τόσο τα άγρια όσο και τα γεωργικά φυτά εξαρτώνται από την επικονίαση για αναπαραγωγή. Τα φρούτα και τα λαχανικά, βασικά συστατικά της ανθρώπινης διατροφής, εξαρτώνται από τις μέλισσες και άλλα έντομα για τη μεταφορά γύρης από λουλούδι σε λουλούδι. Όταν η καταστροφή των οικοτόπων μειώνει τις ποικιλίες αυτών των επικονιαστών, οι αποδόσεις των καλλιεργειών μειώνονται επίσης. Για παράδειγμα, οι μέτριες μέλισσες στην Κόστα Ρίκα που φωλιάζουν μόνο στα δάση αυξάνουν την απόδοση σε φυτείες καφέ που βρίσκονται κοντά σε δασικά μπαλώματα κατά 20%. Πολλά φυτά βασίζονται επίσης σε ζώα, ιδιαίτερα σε αυτά που τρώνε φρούτα, για τη διασπορά των σπόρων. Η καταστροφή του οικοτόπου των ζώων αυτού του τύπου μπορεί να επηρεάσει σοβαρά τα είδη φυτών που εξαρτώνται από αυτά.
Κανονισμός για το κλίμα
Η βιοποικιλότητα επηρεάζει το κλίμα κυρίως μέσω της ρύθμισης της ποσότητας διοξειδίου του άνθρακα στην ατμόσφαιρα. Η καταστροφή των δασικών οικοτόπων μειώνει την ικανότητα των δασών να απορροφούν διοξείδιο του άνθρακα. Ο ρυθμός ανάπτυξης και η ξυλεία ενός φυτού καθορίζουν το ρυθμό ανανέωσης του άνθρακα μέσα σε αυτό. Τα μοτίβα τοπίου είναι επίσης σημαντικά, καθώς η δέσμευση άνθρακα μειώνεται στις άκρες των θραυσμάτων του δάσους. Τα θαλάσσια οικοσυστήματα διαδραματίζουν επίσης σημαντικό ρόλο στη δέσμευση άνθρακα.
Έλεγχος παρασίτων και ασθενειών
Τα παράσιτα στοχεύουν συχνά συγκεκριμένους τύπους φυτών. Όταν τα ενδιαιτήματα καταστρέφονται και μειώνεται η ποικιλομορφία των φυτών, το περιβάλλον περιέχει περισσότερα από έναν συγκεκριμένο τύπο φυτού. Αυτό διευκολύνει την εξάπλωση των παρασίτων. Η ποικιλομορφία των φυτών παρέχει βιότοπους για μεγαλύτερη ποικιλία εντόμων και άλλων ζώων και για τους φυσικούς εχθρούς των παρασίτων. Οι ασθένειες των μυκήτων των φυτών είναι πιο σοβαρές σε περιοχές μονοκαλλιέργειας όπου καλλιεργείται ένας μόνο τύπος καλλιέργειας.
Έμμεσες επιπτώσεις
Η παραγωγή τροφίμων, ρούχων και καταφυγίου για τον άνθρωπο εξαρτάται με πολλούς έμμεσους τρόπους από τη βιοποικιλότητα των οικοσυστημάτων. Η υψηλή ποικιλία γεωργικών καλλιεργειών προστατεύει τους αγρότες από τις αποτυχίες των καλλιεργειών. Η καταστροφή των οικοτόπων και η μείωση της ποικιλομορφίας των ειδών μπορούν να κάνουν τα οικοσυστήματα πιο ευάλωτα στα επεμβατικά είδη και έμμεσα να επηρεάσουν την ανθρώπινη υγεία και ευημερία. Η επίδραση των χωροκατακτητικών ειδών φαίνεται από το τι συνέβη όταν τα μπάσα εισήχθησαν στη λίμνη Gatun του Παναμά. Η παρουσία των μπάσων είχε ως αποτέλεσμα τη μείωση των θηρευτών των προνυμφών των κουνουπιών και την αύξηση της συχνότητας της ελονοσίας.