Пептидите са къси полимерни фрагменти, съставени от аминокиселини. Всеки пептид има определена аминокиселинна последователност, обозначена с трибуквен или еднобуквен код; например аминокиселината аланин е съкратено като "Ala" или "А." Зарядът на пептидите в разтвора зависи от киселинността на разтвора. Изоелектричната точка (pI) се отнася до стойността на киселинността на разтвора, при която пептидната молекула има нетен заряд нула. Разтворимостта на пептида е минимална в изоелектричната точка. Използвайте наличните уеб сървъри, за да изчислите стойността на pI за пептидна аминокиселинна последователност.
Напишете пептидната последователност, като използвате еднобуквен код. Например, ако пептидът има аминокиселинна последователност Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Аланин-Серин-Глуматична киселина-Левцин-Пролин), тогава еднобуквената последователност е "ASELP". Ако е необходимо, направете справка с таблицата за преобразуване на три букви в една буква, дадена в Ресурси.
Използвайте всеки уеб браузър, Internet Explorer или Firefox, например, за да отидете до сървър, който изчислява пептидната изоелектрична точка (pI); вижте Ресурси.
Прочетете стойността на изоелектричната точка (pI), дадена в реда "Теоретични pI / Mw." В нашия пример pI е 4.00. Обърнете внимание, че сървърът също изчислява молекулното тегло (Mw) на пептида.
за автора
Оксана Фокс е писател на свободна практика, специализирана в медицината и лечението, компютърен софтуер и хардуер, цифрова фотография и финансови услуги. Завършила е Московския медицински колеж през 1988 г. с формално обучение по педиатрия.
Снимки Кредити
Comstock Images / Comstock / Getty Images