Нейтрофільні та ацидофільні гетеротрофні бактерії становлять більшість видів бактерій. Терміни "нейтрофільний" та "ацидофільний" стосуються оптимального рівня рН видів бактерій - міри кислотності або основного речовини. Наприклад, оцет вимірює як кислий, а харчова сода як основу. Шкала рН коливається від 0 до 14, з 7, рН чистої води, прямо посередині.
Нейтрофільні гетеротрофи
Більшість бактерій, нейтрофілів, живуть у ґрунті або воді і найкраще ростуть при нейтральному рН від 6 до 8. Якщо рН змінюється занадто далеко за межі цього діапазону, нейтрофільні бактерії не можуть вижити. Більшість бактерій, що викликають захворювання у людей, також є нейтрофільними гетеротрофами, які добре підходять для виживання в організмі людини.
Ацидофільні гетеротрофи
Ацидофільні бактерії краще ростуть при нижчих рівнях рН, як правило, при рН 6, оскільки вони мають біологічні механізми, які дозволяють їм підтримувати внутрішній рН майже нейтральним. Кислий дренаж шахт - забруднений, висококислий стік з гірських районів - містить велику популяцію ацидофілів, які окислюють сульфід, що міститься в рудах металів. За даними Науково-освітнього ресурсного центру в Карлетонському коледжі, ацидофільна фероплазма, виявлена в дренажному шахті з кислотою, виявляла рівень рН до нуля.
Обов’язково ацидофільні гетеротрофи
Облігатним ацидофілам для виживання потрібен низький рН, нижче 4 або 5. Клітинна мембрана облігатних ацидофілів фактично розчиняється при нейтральних рівнях рН, викликаючи загибель клітин. Багато облігатних ацидофілів також є термофілами - організмами, які найкраще ростуть при високих температурах - і зазвичай зустрічаються на вулканічних грунтах. Thiobacillus ferrooxidans, мабуть, є однією з найбільш часто досліджуваних окисно-залізових ацидофільних бактерій.