ระบุไอโซเมอร์โครงสร้าง (ตามรัฐธรรมนูญ) ด้วยรูปแบบพันธะ อะตอมของสารประกอบเหมือนกัน แต่เชื่อมต่อกันเพื่อสร้างกลุ่มฟังก์ชันต่างๆ ตัวอย่างจะเป็น n-butane และ isobutane N-butane เป็นสายโซ่ไฮโดรคาร์บอนแบบตรงที่มีคาร์บอนสี่ตัวในขณะที่ไอโซบิวทีนแตกแขนง ประกอบด้วยสายโซ่ไฮโดรคาร์บอนแบบเส้นตรงที่มีคาร์บอนสามตัวและกลุ่มเมทิลที่หลุดออกจากคาร์บอนตรงกลาง
ระบุสเตอริโอไอโซเมอร์โดยการจัดวางในอวกาศ สารประกอบจะมีอะตอมและรูปแบบพันธะเหมือนกัน แต่จะจัดเรียงต่างกันในพื้นที่สามมิติ ไอโซเมอร์ทางเรขาคณิตเป็นประเภทของสเตอริโอไอโซเมอร์ที่มีการกำหนดค่า
สังเกตว่าไอโซเมอร์จำกัดการหมุนรอบพันธะ เช่น พันธะคู่หรือไม่ นี่คือไอโซเมอร์เรขาคณิต พวกมันจะมีความแตกต่างของซิส-ทรานส์ในพันธะที่จำกัด—ซึ่งหมายถึงการจัดวางกลุ่มฟังก์ชันหรืออะตอมที่ตรงกันข้ามกับด้านใดด้านหนึ่งของพันธะ
ระบุว่าไอโซเมอร์มีจุดศูนย์กลางจัตุรมุขหรือไม่ (ที่มีกลุ่มและ/หรืออะตอมที่แตกต่างกันสี่กลุ่มที่เกิดจากคาร์บอนกลาง) เหล่านี้เป็นชนิดย่อยของไอโซเมอร์ที่เรียกว่าออปติคัลสเตอริโอไอโซเมอร์ซึ่งสามารถระบุได้ว่าเป็นอีแนนทิโอเมอร์หรือไดแอสเทอรีโอเมอร์ ถ้าไอโซเมอร์เป็นภาพสะท้อนในกระจกที่ไม่ซ้อนทับกันของกันและกัน พวกมันคืออีแนนทิโอเมอร์ ถ้าพวกมันเป็นภาพที่ไม่ใช่กระจกสะท้อนซึ่งกันและกันที่เป็นไปไม่ได้ พวกมันคือไดแอสเทอรีโอเมอร์
Anne Mullenniex เขียนเรื่อง eHow มาตั้งแต่ปี 2552 เธอเป็นเจ้าของและดำเนินธุรกิจคอมพิวเตอร์ การก่อสร้าง และประกันภัย เธอสำเร็จการศึกษาระดับปริญญาตรีและปริญญาโทด้านชีววิทยา และเคยสอนที่วิทยาลัยชุมชนแห่งหนึ่ง ปัจจุบันเธอทำงานเป็นศิลปิน/ช่างฝีมือในสื่อต่างๆ