ระบบนิเวศทางทะเลอยู่ภายใต้ความเครียดที่รุนแรง ในหลายพื้นที่เงื่อนไขที่จำเป็นต่อการดำรงชีวิตอยู่ในอันตรายหรือไม่มีอยู่จริง การทำลายแหล่งที่อยู่อาศัยทางทะเลเป็นที่แพร่หลายโดยเฉพาะอย่างยิ่งตามแนวชายฝั่งที่มีประชากรเพิ่มขึ้น การสูญเสียที่อยู่อาศัย มลพิษ การตกปลามากเกินไป การตกปลาแบบทำลายล้าง และ ภาวะโลกร้อน ล้วนบ่อนทำลายสิ่งแวดล้อมทางทะเล
ชายฝั่งทะเล
การสูญเสียแหล่งที่อยู่อาศัย มลภาวะ น้ำที่ไหลบ่า และความเค็มที่เพิ่มขึ้นกำลังทำลายแนวปะการัง หญ้าทะเล และแหล่งที่อยู่อาศัยอื่นๆ ของนกและปลา เนื่องจากพื้นที่ชุ่มน้ำชายฝั่งถูกเติมเต็มเพื่อรองรับประชากรมนุษย์ที่เพิ่มขึ้น การสร้างเขื่อนในแม่น้ำจะลดการไหลของน้ำจืด ชะลอการไหลของสารอาหาร และยับยั้งการอพยพของปลา น้ำจืดน้อยหมายถึงความเค็มที่เพิ่มขึ้นในพื้นที่ชุ่มน้ำและปากแม่น้ำซึ่งเป็นอันตรายต่อหญ้าที่ทำให้น้ำบริสุทธิ์เมื่อไหลลงสู่ทะเล การกัดเซาะที่เกิดจากการตัดไม้ทำลายป่าทำให้เกิดตะกอนในแม่น้ำ ลำธาร และในที่สุดมหาสมุทร ปิดกั้นแสงแดดที่จำเป็นสำหรับแนวปะการังเพื่อความอยู่รอด
ตกปลามากเกินไป
ผลผลิตที่ยั่งยืนสูงสุดคำนวณโดยนักชีววิทยาการประมงเพื่อประเมินปริมาณปลาที่สามารถเก็บเกี่ยวได้จากประชากรโดยไม่เสี่ยงต่อความมีชีวิตในระยะยาว ระหว่างปี พ.ศ. 2517 ถึง พ.ศ. 2542 สัดส่วนการประมงที่เกินผลผลิตที่ยั่งยืนสูงสุดสำหรับปลาคอดเพิ่มขึ้นสามเท่าจากร้อยละ 10 เป็นร้อยละ 30 ตามรายงานของ Center for Ocean Solutions ตั้งแต่ต้นทศวรรษ 1990 มีการจับปลาได้มากที่สุดแห่งหนึ่งของโลก การประมงที่มีประสิทธิผลในทะเลโอค็อตสค์ลดลงระหว่างสองถึงสองครั้งครึ่งอันเนื่องมาจาก ตกปลามากเกินไป ในมหาสมุทรแปซิฟิก มากกว่าครึ่งหนึ่งของประเทศที่เป็นเกาะไม่สามารถจัดการแนวปะการังได้อย่างยั่งยืน
พื้นทะเล
เรือประมงพาณิชย์ใช้วิธีปฏิบัติที่เรียกว่าลากอวนลากอวนขนาดใหญ่ที่ติดอยู่กับตุ้มน้ำหนักหนักข้ามก้นทะเล สายพันธุ์ที่เป็นเป้าหมาย ได้แก่ กุ้ง ปลาค็อด ปลาลิ้นหมา และปลาลิ้นหมา แต่ทุกสิ่งที่อยู่ตามพื้นทะเลถูกจับ การลากอวนด้านล่างอาจทำให้ระบบนิเวศทางทะเลได้รับความเสียหายอย่างถาวร และการจับสัตว์น้ำ (ชนิดที่ไม่ใช่เป้าหมาย เช่น เต่าทะเล นกทะเล และสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม) จะถูกโยนลงน้ำ Bycatch สามารถจับได้มากถึง 90% ของการจับทั้งหมดและปลาใกล้สูญพันธุ์และปะการังน้ำลึกมักถูกฆ่า
การทำให้เป็นกรด
เมื่ออากาศอุ่นขึ้น มหาสมุทรก็ดูดซับคาร์บอนไดออกไซด์มากขึ้น ทำให้เป็นกรดมากขึ้น ความเป็นกรดที่เพิ่มขึ้นยับยั้งความสามารถของสิ่งมีชีวิตในทะเลในการพัฒนาเปลือกหอย ซึ่งรวมถึงสัตว์ขนาดเล็กที่เรียกว่าแพลงก์ตอนซึ่งเป็นฐานของใยอาหารในมหาสมุทร นักวิจัยบางคนแนะนำว่าสิ่งนี้จะทำให้สัตว์ทะเลบางชนิดปล่อยสารประกอบกำมะถันน้อยลงซึ่งส่งเสริมการก่อตัวของเมฆซึ่งทำให้โลกเย็นลง แบบจำลองสภาพภูมิอากาศคาดการณ์ว่าสิ่งนี้จะทำให้อุณหภูมิเพิ่มขึ้น 0.5 องศาเซลเซียส (0.28 องศาฟาเรนไฮต์) ในช่วงศตวรรษนี้