กล้องจุลทรรศน์มีมานานแล้ว คิดค้นขึ้นในช่วงศตวรรษที่ 16 เทคโนโลยีได้รับการปรับปรุงอย่างต่อเนื่องตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา นับตั้งแต่มีกล้องส่องทางไกลรุ่นคลาสสิกเรียบง่าย กล้องจุลทรรศน์ถูกนำมาใช้ในบริบทที่หลากหลายในการลงทุนที่แตกต่างไปจากอุตสาหกรรมยานยนต์และยา ขีดจำกัดทางธรรมชาติของดวงตามนุษย์ได้รับการเสริมอย่างต่อเนื่องเพื่อทำงานพื้นฐานของอุตสาหกรรม
ชิ้นส่วนที่เกี่ยวข้องกับเครื่องจักรที่ทันสมัยที่ซับซ้อน เช่น รถยนต์ มีขนาดเล็กมากจนต้องใช้กล้องจุลทรรศน์อย่างหลีกเลี่ยงไม่ได้ การใช้กล้องจุลทรรศน์ที่ออกแบบมาเป็นพิเศษสำหรับงาน วิศวกรสามารถประเมินข้อบกพร่องและการแตกหักได้แม้เกียร์ที่เล็กที่สุด กล้องจุลทรรศน์ยังใช้ในลักษณะนี้เพื่อตรวจสอบชิ้นส่วนต่างๆ ของเครื่องจักร เช่น นาฬิกาและเครื่องยนต์ที่ใช้ขับเคลื่อนเรือและเครื่องบิน
วิศวกรรมวัสดุมีความซับซ้อนมากขึ้น เนื่องจากมีการพัฒนาวัสดุใหม่เพื่อรองรับงานที่หลากหลายที่สุด การใช้วัสดุที่ออกแบบมาเป็นพิเศษ วิศวกรได้ปรับปรุงทุกอย่างตั้งแต่การก่อสร้างอาคาร วัสดุบรรจุภัณฑ์ ไปจนถึงเสื้อผ้าที่ผู้คนสวมใส่ กล้องจุลทรรศน์มีความสำคัญอย่างยิ่งในกระบวนการนี้ ทำให้ผู้เชี่ยวชาญสามารถตรวจสอบรูปแบบพื้นฐานของวัสดุที่พวกเขาสร้างขึ้นได้ การใช้กล้องจุลทรรศน์จะมีความสำคัญมากขึ้นกับวัสดุนาโนชนิดใหม่เท่านั้น
กล้องจุลทรรศน์เป็นเครื่องมือสำคัญในวงการแพทย์มาโดยตลอด กล้องจุลทรรศน์อนุญาตให้มีการค้นพบทฤษฎีเชื้อโรคที่เปลี่ยนแปลงโลกซึ่งช่วยชีวิตผู้คนนับไม่ถ้วน ปัจจุบันกล้องจุลทรรศน์ถูกนำมาใช้ในการสังเกตแบคทีเรียและจุลินทรีย์ ตลอดจนในการพัฒนาสารเคมีและยาใหม่ๆ ที่ใช้ในการต่อสู้กับโรค การพัฒนายาใหม่ได้รับความช่วยเหลืออย่างมากจากการใช้กล้องจุลทรรศน์กำลังสูง