มีปฏิกิริยาเคมีเกิดขึ้นตลอดอายุขัยของพืช ทุกช่วงเวลาของชีวิตของพืช ปฏิกิริยาเคมีจะควบคุมการใช้พลังงาน ระดับน้ำ และการแลกเปลี่ยนก๊าซ ในขณะที่มีปฏิกิริยาเคมีที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของพืชมากเกินไปจนไม่สามารถระบุได้ และอีกหลายประเภท ของพืชได้รับปฏิกิริยาเคมีประเภทต่างๆ -- มีปฏิกิริยาพื้นฐานที่สำคัญบางประการที่เกิดขึ้นในพืชทุกชนิด
การสังเคราะห์ด้วยแสงเป็นกระบวนการทางเคมีที่พืชเปลี่ยนแสงแดดเป็นกลูโคส กลูโคสเป็นคาร์โบไฮเดรตที่พืชใช้เป็นพลังงาน ในระหว่างการสังเคราะห์ด้วยแสง คลอโรฟิลล์จะเปลี่ยนโฟตอน น้ำ และคาร์บอนไดออกไซด์เป็นกลูโคสและออกซิเจน โรงงานผลิตออกซิเจนสร้างบรรยากาศที่ระบายอากาศได้สำหรับชีวิตสัตว์
การสังเคราะห์ด้วยแสงไม่ใช่ปฏิกิริยาเคมีเพียงอย่างเดียวที่สร้างพลังงานในพืช การหายใจเป็นกระบวนการที่พืชเปลี่ยนกลูโคสและออกซิเจนเป็นอะดีโนซีน ไตรฟอสเฟต หรือ ATP ซึ่งเป็นสารประกอบที่ใช้เป็นเชื้อเพลิงในปฏิกิริยาเคมีอื่นๆ ในพืช การหายใจเกี่ยวข้องกับวัฏจักรเคมีที่แตกต่างกันสี่รอบ: glycolysis กระบวนการที่กลูโคสถูกเปลี่ยนเป็น puyruvate; ปฏิกิริยาการเปลี่ยนแปลงหรือ pyruvate decarboxylation เมื่อ pyruvate รวมกับโคเอ็นไซม์ A เพื่อสร้าง acetyl CoA; วงจร Krebs ซึ่ง CoA ถูกเติมออกซิเจน และห่วงโซ่การขนส่งอิเล็กตรอนซึ่งสร้าง ATP ให้เสร็จสมบูรณ์
กิจกรรมของปากใบพืช - โครงสร้างคล้ายรูพรุนที่ควบคุมการขนส่งทางน้ำ ความเย็น และการหายใจ - ส่วนใหญ่ควบคุมโดยปฏิกิริยาเคมีที่เกี่ยวข้องกับโพแทสเซียม เมื่อโปแตสเซียมถูกนำเข้าสู่เซลล์ป้องกันรอบๆ ปากใบ จะทำให้โปแตสเซียมบวมและเปิดออก เมื่อมีน้ำในสิ่งแวดล้อมน้อยลง โพแทสเซียมจะถูกสูบออกจากเซลล์ป้องกันและปิดปากใบ เพื่อรักษาน้ำภายในโรงงาน พืชที่ไม่มีโพแทสเซียมเพียงพอจะควบคุมระดับน้ำได้น้อย