น้ำสามารถปนเปื้อนได้จากหลายแหล่ง ตั้งแต่โรงบำบัดน้ำเสียและโรงงานไปจนถึง กิจกรรมการทำเหมือง ถนนลาดยาง และการไหลบ่าของการเกษตร ตาม U.S. Environmental Protection หน่วยงาน มลพิษทางน้ำมีผลกระทบมากมายต่อชีวิตพืชและต่อสิ่งแวดล้อมโดยทั่วไป มลพิษในน้ำไม่เพียงเป็นอันตรายต่อการเจริญเติบโตของพืช แต่ยังช่วยให้พืชสามารถดูดซับสารเคมีอันตรายจากน้ำและส่งต่อไปยังสัตว์ที่พึ่งพาพวกมันเพื่อความอยู่รอด พืชยังถ่ายทอดมลพิษเหล่านี้ไปยังมนุษย์ที่บริโภคพวกมัน
ใบไม้และเปลือกเสียหาย and
ฝนกรดประกอบด้วยกรดกำมะถันและกรดไนตริก ซึ่งสามารถทำลายใบและเปลือกไม้และทำร้ายรากขนละเอียดของพืชหลายชนิด พืชต้องการขนรากที่ละเอียดเหล่านี้เพื่อดูดซับน้ำ ตามที่โรงเรียนมัธยม Patchogue-Medford ในนิวยอร์ก ฝนกรดเป็นผลมาจากการผสมสารประกอบ เช่น ซัลเฟอร์ไดออกไซด์และไนโตรเจนออกไซด์กับออกซิเจน น้ำ และสารเคมีอื่นๆ ในบรรยากาศ สารประกอบหลายชนิดที่ทำให้เกิดฝนกรดนั้นเกิดจากโรงไฟฟ้าที่เผาไหม้เชื้อเพลิงฟอสซิล เช่น ถ่านหิน รวมถึงไอเสียจากรถโดยสาร รถบรรทุก และรถยนต์
ปัญหาการสังเคราะห์แสง
มลพิษทางน้ำจากสารต่างๆ สามารถขัดขวางการสังเคราะห์แสงในพืชน้ำได้ ตามรายงานของ Tropical-Rainforest-Animals.com การสังเคราะห์ด้วยแสงเป็นกระบวนการที่พืชใช้พลังงานจากแสงแดดเพื่อผลิตน้ำตาลหรือกลูโคส โดยเปลี่ยนคาร์บอนไดออกไซด์ให้เป็นคาร์โบไฮเดรต อย่างไรก็ตาม เมื่อน้ำมีมลพิษ ความสามารถของน้ำในการละลายก๊าซ เช่น คาร์บอนไดออกไซด์ จะได้รับผลกระทบในทางลบ TutorVista.com รายงาน เนื่องจากพืชที่เติบโตในน้ำหรือในดินที่มีน้ำขัง หรือเรียกอีกอย่างว่าไฮโดรไฟต์ ขึ้นอยู่กับการสังเคราะห์แสงเพื่อความอยู่รอด การแทรกแซงในกระบวนการสังเคราะห์แสงจึงสามารถฆ่าพวกมันได้
ปัญหาดิน
น้ำที่ปนเปื้อนในดินจะช่วยชะล้างสารอาหารที่จำเป็นที่พืชต้องการออกจากดิน มลพิษทางน้ำทำให้ดินมีสภาพเป็นกรดและส่งผลเสียต่อการละลายของธาตุอาหารไอออน เช่น เหล็ก แมกนีเซียม โพแทสเซียม และแคลเซียมไอออน เป็นผลให้น้ำกำจัดสารอาหารเหล่านี้ออกจากดินได้เร็วขึ้นและส่งไปยังลำธารและทะเลสาบตามที่มหาวิทยาลัยคอร์เนลล์ในนิวยอร์ก โดยเฉพาะอย่างยิ่งแคลเซียมและแมกนีเซียมมีความสำคัญต่อการเจริญเติบโตของพืชอย่างเหมาะสม ธาตุเหล็กช่วยให้พืชสร้างเม็ดสีคลอโรฟิลล์ ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างอาหาร ในขณะที่โพแทสเซียมช่วยให้พืชใช้น้ำได้ หากไม่มีสารอาหารเหล่านี้ พืชจะอ่อนไหวต่อความแห้งแล้ง การติดเชื้อรา และแมลงมากขึ้น มลพิษทางน้ำยังทิ้งอลูมิเนียมจำนวนมากไว้ในดิน ซึ่งอาจเป็นอันตรายต่อพืช