På jorden driver solens energi vindarna; så på Neptunus, där solen inte syns mycket större än en stjärna, skulle man förvänta sig svaga vindar. Motsatsen är dock sant. Neptunus har de starkaste ytvindarna i solsystemet. Det mesta av den energi som driver dessa vindar kommer från själva planeten.
Jämfört med någon av gasjättplaneterna är jordens atmosfär en pool av lugn. På Jupiter når vindar i den lilla röda fläcken 618 kilometer i timmen (384 mil i timmen), vilket är nästan dubbelt så snabbt som vindarna i den hårdaste terrestriska orkanen. På Saturnus kan vindar i den övre atmosfären blåsa nästan tre gånger hårdare än så, med 1 800 kilometer i timmen (1118 mil i timmen). Till och med dessa vindar tar baksätet till de nära Neptuns stora mörka fläck, som astronomer har klockat till 1 931 kilometer i timmen (1 200 mil i timmen).
Precis som Jupiter och Saturnus genererar Neptun mer energi än den tar emot från solen, och den energi som strålar ut från planetens kärna är det som driver de starka ytvindarna. Jupiter utstrålar energi som är kvar från sin bildning, och den energi som Saturnus utstrålar är till stor del ett resultat av friktion som produceras av heliumregn. På Neptun fångar en filt av metan - som är en växthusgas - värme. Om planeten var som Uranus (som saknar en intern energikälla) skulle den värmen ha strålat ut i rymden för länge sedan. I stället, även om temperaturen är kylig, strålar planeten 2,7 gånger mer värme än den tar emot från solen, vilket räcker för att driva sina våldsamma vindar.