Еукариоти су било које врсте организама који имају сложене ћелије које укључују митохондрије, језгра и друге делове ћелија. Три главне ћелијске групе су гљиве, биљке и животиње. Многе гљиве су само површно повезане са биљкама. Можда изгледају некако као биљке и имају ћелијске зидове који су слични зидовима биљних ћелија, али постоји френолошко стабло које показује како гљиве могу бити ближе повезане са животињама од биљака. Будући да су животиње у еволуционој историји ближе гљивицама него биљкама, могло би се рећи да је печурка човеку ближа "сродност" него поврћу на салати.
Беланчевина
Протеинске секвенце гљива сличније су животињама него биљкама. На пример, протеини калупа у ћелијској слузи више личе на животињске него на биљне протеине. Дужина рибозома у гљивама показује аминокиселину која је слична мишићу. У ствари, постоји неколико аминокиселинских секвенци које су сличне протеинима тешког ланца код сисара. Једна од ових аминокиселина је 81 одсто идентична људској аминокиселини.
Хлорофил
Биљна целулоза се разликује од целулозе гљивица. Када се рендгенско зрачи, биљна целулоза је кристалнија од целулозе гљива. И гљиве и животиње не садрже хлоробласте, што значи да ни гљиве ни животиње не могу да обрађују фотосинтезу. Хлорофил чини биљке зеленим и обезбеђује исхрану биљака. Супротно томе, гљиве ензимским процесом апсорбују хранљиве састојке из биљног материјала који се разлаже, а животиње уносе храну.
Хитин
Гљиве и животиње садрже молекул полисахарида назван хитин који биљке не деле. Хитин је сложени угљени хидрат који се користи као структурна компонента. Гљиве користе хитин као структурни елемент у ћелијским зидовима. Код животиња хитин се налази у егзоскелетону инсеката и у кљуновима мекушаца. Хитин функционише слично као биљна целулоза, али хитин је јачи. Студије рађене на полисахаридима гљива показале су да је додавање алкалија које садрже азот уништило гљиве и произвело сирћетну киселину. Ове хемијске реакције се нису десиле у биљним полисахаридима.
Гљивице нису алге
Алге су најједноставније и најпримитивније биљке. Године 1955. др Џорџ В. Мартин је закључио да су гљивице изведене из алги које су изгубиле хлорофил. Међутим, Мартинова хипотеза није сматрала да су атмосферски услови могли бити другачији када је живот започео од оних који су били 1955. године. Такође, Мартин није узео у обзир да су бактерије које фиксирају азот могле постојати и пре него што су биљке еволуирале, а које су могле да се користе као извор хране за гљивице. 1966. године др А.С. Суссман је приметио да, иако гљиве изгледају површно попут алги, постоје аспекти гљивица, попут ћелијских језгара и организације, који се не могу објаснити.
Стероли
Неки биолози су навели да су животињски и гљивични стероли различити, стога гљиве не могу бити сличне животињама. Животиње производе холестерол, док гљиве производе ергостерол. Након детаљнијег испитивања, и гљивични и животињски стероли садрже ланостерол, док фитостероли у зеленим биљкама садрже циклоартенол.
Сопствена категорија?
Можда гљиве нису ни од биљака, ни од једноћелијских животиња. Неки биолози тврде да се гљивице филогенетски разликују од свих осталих еукариота. Чини се да су гљивице јединствене по томе што саме захтевају фактор издужења транслације под називом ЕФ-3. Постоје неке активности протеина које су од суштинског значаја за продужење транслације ин виво.