Ензим је изузетно сложен протеин који се понаша као катализатор реакција. Катализатор је супстанца која повећава брзину хемијске реакције, а да је сама реакција не потроши. Ензими су критични за живот и свеприсутне су природе. Пошто ензими имају врло специфичну тродимензионалну структуру, промене услова као што су температура и пХ могу утицати на њихову ефикасност.
Денатурација
Тродимензионална структура ензима формира активно место, или пословни крај ензима, где се одвија реакциона катализа. На промене на овом активном месту могу утицати фактори као што су пХ или температура, па ће ефикасност ензима бити смањена када не постоје оптимални услови. Када ензим изгуби облик, то се назива денатурација.
Бочни ланци аминокиселина
Аминокиселине које чине протеине, а самим тим и ензиме, чине централни атом угљеника, атом водоника, амино група, група карбоксилне киселине и "Р" група. Р група се назива и бочни ланац. Бочни ланац или Р група је специфичан распоред атома који чини ту аминокиселину јединственом и може се понашати као слаба киселина или база у раствору и има одређено стање јонизације. Ово стање јонизације утиче на структуру ензима.
Ефекат пХ
Сви ензими имају оптималан пХ при којем најбоље функционишу. ПХ омогућава ензиму да преузме одређену конформацију која одговара облику активног места ензима. Када је активно место правог облика, оно је у стању да се ефикасно веже за подлогу или почетни материјал реакције и катализује реакцију. Активно место је резултат специфичне конформације бочних ланаца аминокиселина ензима, који формирају слабе асоцијације једна на другу због њиховог стања јонизације и чине резултирајућу специфичну тродимензионалну структуру ензим. Без тачног пХ, ова тродимензионална структура неће се правилно формирати. Биохемијски пуфери у живим системима су у стању да одрже ензим у његовом оптималном опсегу пХ.
Утицај температуре
Температура утиче и на тродимензионалну структуру ензима. Сваки ензим има оптималан опсег температуре у оквиру којег најбоље функционише. Превисока температура денатурира структуру ензима, мењајући облик његовог активног места, тако да не може ефикасно да катализује реакцију. Прениска температура неће пружити довољно енергије систему да би реакција напредовала максималном брзином.