За разлику од језера и бара, реке су отворени системи, где се дешава честа размена воде. Упркос овој чињеници, организми који зависе од река захтевају извесну равнотежу. Разни индикатори дају меру квалитета реке. Ова мерења укључују растворени кисеоник, температуру и пХ, што је мера концентрације водоникових јона.
Скала за мерење пХ креће се од 0 до 14 са 7 или испод представља кисело окружење, а очитавање преко 7 указује на алкално окружење.
Студија објављена у часопису Натуре директно је повезала киселост у норвешким рекама и језерима са киселом кишом, која је десетковала локалне популације лососа и пастрмке.
Ниски нивои пХ узрокују убијање риба стресом на животињским системима и наношењем физичке штете, што их пак чини рањивијим на болести.
Остали спољни фактори који могу изазвати флуктуације пХ вредности реке укључују пољопривредни отицај и кисели рудник дренажа (АВД) и емисије фосилних горива као што је угљен-диоксид, који ствара слабу киселину када се раствори у реци воде.
Испитивање нивоа пХ указује на киселост или алкалност узорка. Реке имају одређени капацитет да спрече промене пХ због структуре и састава речног корита. Међутим, драстичне промене пХ могу имати штетне ефекте на здравље река.