Tako kot večina biomov na Zemlji tudi ekosistem savane preživi v občutljivem ravnovesju med okoljskimi dejavniki in različnimi vrstami, vključno z ljudmi. Huda suša lahko tem travinjem oropa življenje in listje, medtem ko lovci in staroselci pogosto grozijo, da bodo prekinili prehranjevalni splet z usmrtitvijo živali za šport oz preživetje.
Človeške dejavnosti
Človeške dejavnosti lahko močno ogrozijo ekosisteme savane. Nestanovitna raba vode in namakalne metode bi lahko izsušile reke in vodne luknje, ki dajejo življenje. V regijah, kjer avtohtoni prebivalci redno vključujejo v svojo prehrano grmičevje - divje meso -, je populacija kopitarjev opazno upadla. Nekatere prostoživeče živali savane lovijo tudi kot trofeje; zlasti črne nosoroge lovijo zaradi dragocenih rogov. Tudi nekatere rastlinske vrste so zaradi svoje tržne vrednosti prekomerno nabrane. Rezbarije iz afriškega črnega lesa, drevesa savane, se pogosto prodajajo na turističnih trgih.
Suša in močna paša
Dolgotrajna huda suša ima nevaren učinek na ekosistem savane, pašni vzorci pa ta učinek poslabšajo. Kombinacija hude suše in paše lahko spremeni travinje predvsem z užitnimi trajnicami v savano, v kateri prevladujejo neužitne trave in rastline. Rahlo pašna travišča ohranjajo svojo kakovost okusnih, večletnih vrst trav, vendar je sestavo rastlinskih vrst še vedno mogoče spremeniti. Strokovnjaki so pozvali, naj rešitve za upravljanje paše med epizodami suše vplivajo na smer potencialnih sprememb v smeri trajnosti travinja.
Dezertifikacija
Tropske savane pogosto mejijo na sušna, puščavska območja, širjenje puščavskih razmer pa na suha travišča imenujemo dezertifikacija. Ta grožnja za ekosistem savane vključuje učinke, ki jih povzročajo podnebne spremembe, kmetijske prakse, prekomerna paša, agresivno namakanje kmetij, ki znižuje gladino vode stran od korenin rastlin, krčenja gozdov in erozija. Vsako leto več kot 46.000 kvadratnih kilometrov afriške savane postane puščava. Sajenje rastlin, odpornih proti suši, bi lahko stabiliziralo premikanje peščenih sipin in začelo širjenje dodatne vegetacije.
Ogljikovi izpusti
Raziskava iz leta 2012 je velik porast lesno rastlinske mase pripisala "učinku gnojenja s CO2". Avtorji ugotovil, da je povečanje stopnje rasti gozdnatih rastlin povzročilo povečanje atmosferskega ogljika dioksid. Dramatično povečanje količine dreves in grmovnic bi lahko ogrozilo celoten ekosistem savane, saj te rastline porabijo več vode kot trave. Naravoslovci v Namibiji poročajo, da lesnate rastline ovirajo antilope in gepardi, ki jih lovijo - razvoj, ki bi lahko imel neznane posledice po vsej Sloveniji travniki.
