Centrifuga je naprava, sestavljena iz predelka, ki se vrti na osrednji osi. Zaradi vrtenja se materiali ločijo glede na njihovo različno težo. Rotor centrifuge je vrtljiva enota centrifuge, ki ima fiksne luknje, izvrtane pod kotom. Epruvete so nameščene znotraj teh lukenj in rotor se vrti, da pomaga pri ločevanju materialov. Obstajajo tri vrste rotorjev za centrifuge: vrtljivi žlice, fiksni in vertikalni rotorji.
Rotor z nihajnim vedrom običajno podpira vzorce v prostornini od 36 ml do 2,2 ml. Gugalne žlice lahko podpirajo dve vrsti ločevanja: hitrostno-zonsko in izopiknično. Nihajna vedra so najprimernejša za ločevanje od območja hitrosti, ker je razdalja med zunanjo stranjo meniskusa in zunanjostjo dna cevi dovolj dolga, da lahko pride do ločevanja.
Rotorji s fiksnim kotom se običajno uporabljajo za peletiranje delcev pelete iz suspenzije in odstranjevanja odvečnih ostankov ali zbiranja pelete. Votline rotorja se gibljejo od 0,2 ml do 1 ml. Najpomembnejši vidik pri odločitvi za uporabo rotorja s fiksnim kotom je faktor K. Faktor K kaže, kako učinkovito lahko rotor peleti z največjo hitrostjo. Nižji kot je faktor K, večja je učinkovitost peletiranja.
Navpični rotorji so visoko specializirani. Običajno se uporabljajo za povezovanje DNA v cezijev klorid. Navpični rotorji imajo zelo nizke faktorje K, kar je koristno, če se mora delec premakniti le na kratko razdaljo, dokler se ne peleti. Čas delovanja na navpičnih rotorjih je kratek.