Čo je vymenovanie v mikrobiológii?

Mikrobiológia je štúdium mikroorganizmov: mikroskopické alebo sotva viditeľné jednobunkové formy života ako napr baktérie, archea, prvoky a niektoré huby a dokonca aj niektoré extrémne malé mnohobunkové rastliny, zvieratá a huby. Mikrobiológovia študujú aj realistické neorganické javy, ako sú vírusy, prióny, viroidy a virióny. „Mikrób“ je všeobecný pojem pre všetky tieto subjekty. Enumerácia v mikrobiológii je stanovenie počtu jednotlivých životaschopných mikróbov vo vzorke; sú možné štyri základné techniky.

Jedným priamym meradlom pre mikrobiálny výpočet je štandardný počet doštičiek, ktorý sa tiež nazýva životaschopný počet. Pre tento počet kultivujete vzorku tak, že ju zriedite, dáte na misky s kultivačným médiom a inkubujete ich po stanovenú dobu. Potom spočítate počet kolónií a pomocou tohto počtu odvodíte pôvodný počet mikróbov vo vzorke. Technicky vzaté, počet doštičiek neposkytuje počet jednotlivých mikróbov, ale skôr „tvorbu kolónií“ jednotky, „pretože nemôžete s istotou vedieť, či každá kolónia skutočne pochádzala z jedného mikróbu alebo z malej skupiny mikróby. Tieto počty sa však považujú za veľmi presné na odhad počtu mikróbov v pôvodných vzorkách. Nevýhodou je, že tento test je časovo a priestorovo náročný a vyžaduje špeciálne vybavenie, ktoré musí byť pripravené správne.

Priame mikroskopické počty, ktoré sa tiež nazývajú celkové počty buniek, sú ďalšou formou priameho výpočtu. Najskôr vzorku rozdelíte do niekoľkých rovnako veľkých komôr. Potom určíte priemerný počet mikróbov na komoru spočítaním niektorých alebo všetkých pod mikroskopom. Nakoniec použijete tento priemer na výpočet počtu v pôvodnej jednotke. Hlavnou nevýhodou priamych mikroskopických počtov je, že je ťažké rozlíšiť živé mikróby od mŕtvych, takže táto metóda nemusí poskytnúť presný životaschopný počet.

Testy zákalu sú formy nepriameho výpočtu. Zákal je zakalenie kvapaliny. Pri turbidimetrickom meraní vložíte vzorku do roztoku a zmeriate oblačnosť nového roztoku tak, že cez neho svietite svetlo pomocou spektrofotometra potom odhadnite počet živých mikróbov, ktoré by boli potrebné na vytvorenie pozorovanej úrovne zákalu. Nevýhodou je, že niekto už musel urobiť početné štandardné počty platní príslušného mikróbu aby ste vyrobili vzorkové roztoky s rôznym zákalom, aby ste mali štandard na meranie svojej súčasnej vzorky proti. Musíte si tiež dať pozor na prílišnú koncentráciu svojej vzorky, pretože turbidimetrický počet je presný, iba ak žiadne mikróby vo vzorke neblokujú žiadne ďalšie. Pri vizuálnom porovnaní zákalu porovnávate zákal svojej vzorky s zákalom jednotky rovnakej veľkosti a známeho počtu mikróbov a na základe tohto porovnania odhadnete výpočet.

Dve ďalšie formy nepriameho výpočtu sú hromadné stanovenie a meranie mikrobiálnej aktivity. Pri výpočte hromadného určenia odvážite množstvo biologickej hmoty vo vzorke. Porovnajte to hmotnosť na štandardnú krivku pre známe počty mikróbov a odhadnúť z toho pôvodné mikrobiálne číslo porovnanie. Na meranie mikrobiálnej aktivity meriate množstvo biologického produktu vo vzorke, ako je napr metabolický odpad, potom to porovnajte so štandardnou krivkou pre známe počty a odhadnite z toho svoj počet porovnanie.