V USA sa každý rok vyskytne viac ako miliarda prípadov bežného nachladnutia. Napriek svojmu názvu nie je prechladnutie v skutočnosti jednou chorobou. V skutočnosti je to spôsobené rôznymi vírusmi, ktoré majú všetky spoločné znaky, medzi nimi aj časti tela, ktoré infikujú - nos a hrdlo. Každý z vírusov zodpovedných za prechladnutie má inú evolučnú históriu.
Mylné predstavy
Na rozdiel od všeobecného vnímania existuje viac ako 200 vírusov, ktoré spôsobujú bežné prechladnutie. Ľudské rinovírusy sú zďaleka najbežnejšie a môžu sa pochváliť najmenej 99 rôznymi kmeňmi. Koronavírusy sú na druhom mieste a spôsobujú asi 1/3 nachladnutia. Metapneumovírusy sú ďalším typom patogénov, ktoré spôsobujú príznaky nachladnutia aj u ľudí.
Vírusová evolúcia
Teória evolúcie vysvetľuje, ako vznikli rinovírusy a koronavírusy. Aj keď vírusy nie sú všeobecne klasifikované ako živé organizmy, pri infikovaní hostiteľskej bunky ju používajú na svoju replikáciu. V procese sa však často vyskytujú chyby, takže niektoré z vírusov sú mutanty, ktoré majú inú genetickú informáciu ako pôvodný vírus. Tieto mutácie vytvárajú genetickú rozmanitosť v populácii, čo znamená, že existujú rôzne genetické varianty toho istého vírusu. Dôležitú úlohu vo vývoji vírusu zohrávajú aj ďalšie faktory, ako napríklad rekombinácia, pri ktorej viac kmeňov infikuje toho istého hostiteľa a vymieňa si niektoré zo svojich genetických informácií. Koronavírusy aj rinovírusy majú vysokú mieru chybovosti počas replikácie, a tak sa môžu rýchlo vyvíjať a vytvárať nové kmene.
Evolúcia rinovírusu
V roku 2009 vedci z ústavu J. Craig Venter Institute a University of Wisconsin publikovali genómy všetkých 99 kmeňov ľudského rinovírusu. Údaje z tohto úsilia použili na rozuzlenie vzťahov medzi rôznymi kmeňmi, zostavenie rodokmeňa a pokus o osvetlenie histórie ľudského rinovírusu. Aj keď sa predtým verilo, že existujú tri druhy ľudského rinovírusu, konkrétne HRV-A, HRV-B a HRV-C, údaje zo štúdie z roku 2009 naznačovali existenciu štvrtého, HRV-D. Tiež sa navrhuje, aby kmene HRV-A a HRV-C mali spoločného predka a boli úzko spojené so skupinou HRV-B. HRV najviac súvisia s ľudskými enterovírusmi (HEV), čo sú vírusy, ktoré primárne infikujú gastrointestinálny trakt. V súčasnosti sa verí, že HRV majú spoločného predka s HEV a že HRV-B je príbuznejšia s HEV ako ostatné, aj keď nie je známe, či sa každý druh odlišuje.
Metapneumovírus
Metapneumovírus je ďalšou odrodou, ktorá spôsobuje príznaky nachladnutia u ľudí. Štúdia z roku 2008 v časopise „Journal of Virology“ porovnávala genetiku metapneumovírusov u ľudí a vtákov a zistila, že ľudská verzia vírusu súvisí s kmeňmi nachádzajúcimi sa u vtákov. Údaje z analýzy v štúdii naznačujú, že vtáčia verzia sa mohla preniesť na človeka asi pred 200 rokmi.
Evolúcia koronavírusu
Výskum vývoja koronavírusov sa zameral predovšetkým na verziu SARS, kvôli širokej publicite, ktorú získal po smrteľnom prepuknutí v roku 2003. Koronavírusy sa dajú rozdeliť do troch skupín a ich evolučná história je zložitá. Ako je uvedené v štúdii z roku 2007 v „Journal of Virology“, existujú určité dôkazy naznačujúce, že všetky moderné línie koronavírusov môžu pochádzať od spoločného predka, ktorý infikoval netopiere a neskôr prešiel k infikovaniu iných druhov, vrátane ľudí.