Identifikácia skamenených druhov dreva môže byť náročná a niekedy nemožná úloha. Niektoré kúsky dreva stratia počas procesu skamenenia toľko svojej pôvodnej bunkovej štruktúry, že je nemožné získať dostatok informácií na ich identifikáciu. Niektoré druhy dreva sú dostatočne zreteľné na to, aby ich začiatočníci spoznali iba s 10-násobným zväčšením. Aj tie najlepšie exempláre niektorých drevín potrebujú na identifikáciu výcvikové a zväčšovacie zariadenie.
Prvé stopy
O tom, či je možné kus identifikovať, rozhoduje kvalita dreva. Pôvodná bunková štruktúra je skamenením niekedy úplne zničená. Ak v dreve vidíte vzory, je veľká šanca, že ho bude možné identifikovať. Pri identifikácii vášho kúska tiež pomôže vedieť, aké druhy stromov rastú v oblastiach, v ktorých sa drevo nachádzalo. Ak je možné exemplár zúžiť na niekoľko možností, je možné vylúčiť niektoré druhy, pretože by sa s najväčšou pravdepodobnosťou nenašli u známych druhov z tejto oblasti. Zvyšok procesu identifikácie si vyžaduje zväčšenie.
Bunkové štruktúry
Niektoré bunkové štruktúry sú zjavné iba so zväčšením 10x. Iné môžu vyžadovať až 800-násobné zväčšenie. Bunky (tracheidy) rôznych tried dreva sú usporiadané do rôznych vzorov. Napríklad pri pohľade naprieč drevom, ako by ste to mali pri pohľade na rastové krúžky, má ihličnatý strom malé okrúhle bunky, ktoré tvoria pomerne priame čiary. Krytosemenné rastliny (dub, orech, platan) majú skôr nádoby ako tracheidy, ktoré sú podobné, ale netvoria úhľadné rady ani nie sú vždy okrúhle. Ginko má ešte inú bunkovú formáciu, ktorá je podobná kukurici. Poznanie bunkovej štruktúry rôznych foriem dreva je nevyhnutné pre správnu identifikáciu.
Lúče a ďalšie charakteristické vlastnosti
Lúče sú dôležitým ukazovateľom druhov dreva. Lúče sú čiary malých buniek, ktoré vedú od stredu guľky po kôru. V niektorých druhoch dreva sú tieto lúče tenké, niekedy široké iba jednu alebo dve bunky a v iných zasa širšie alebo rôznej šírky. Ovocné stromy majú veľa šírok lúčov, zatiaľ čo borovica úzke a rovnomerné lúče. Niektoré dreviny majú iné charakteristické črty. Napríklad borovica má „živicové kanály“. Tieto kanály vyzerajú ako bunky, ale sú oveľa väčšie. Ak sa nachádzajú v dreve s malými priamymi líniami buniek a úzkymi lúčmi, nie je potrebné ďalšie skúmanie, aby sa zistilo, že ide o drevo borovice.
Vyšetrovacie metódy
Vyšetrenie sa často robí tak, že sa z dreva vyrobí kocka, aby ju bolo možné vidieť z rôznych uhlov osi. Kocky dreva sú jemne brúsené, aby odstránili škrabance, ktoré môžu brániť identifikácii. Ak je potrebné vysoké zväčšenie, použijú sa tenké plátky dreva hrubé iba niekoľko buniek. Skúšajúci musí poznať aspekty rôznych drevín, takže do procesu je zapojené aj určité vzdelávanie. Technológia uľahčuje identifikáciu pomocou počítačového softvéru, ktorý pomáha v procese identifikácie. Tento softvér si môže online kúpiť každý, kto sa chce venovať oblasti identifikácie fosílneho dreva.