Väčšina Aljašky je obklopená vodou. Na severe a severozápade sa nachádzajú dve vodné plochy na Aljaške, Beaufortovo more a Čukotské more, ktoré obidve splývajú do Severného ľadového oceánu. Na juhovýchod je Aljašský záliv, ktorý prechádza do Tichého oceánu. Beringovo more je na juhozápad.
Arktický oceán
Severný ľadový oceán je najmenší zo všetkých oceánov. Leží takmer úplne nad polárnym kruhom a je extrémne chladný a väčšinu času pokrytý ľadom. Je rozdelená na dve povodia, Euroázijskú kotlinu a Severoamerickú kotlinu, pohorím Lomonosov. Výtoky pre tento oceán sú Beringov prieliv medzi Aljaškou a Ruskom; Davisov prieliv, medzi Grónskom a Kanadou; a Dánskym prielivom a Nórskym morom medzi Grónskom a Európou. Tento oceán je domovom rýb, tuleňov, mrožov a veľrýb kvôli svojej nízkej teplote. Stred tohto oceánu je pokrytý priemerným polárnym ľadovým obalom s hrúbkou 10 stôp, ktorý sa v zimných mesiacoch rozprestiera smerom von, zdvojnásobuje sa a siaha až po obklopujúce pevniny. Počas letných mesiacov ľadový obklad obklopujú otvorené more, ale nikdy úplne nezmizne.
Tichý oceán
Tichý oceán je najväčší zo všetkých oceánov. Pokrýva asi 28 percent globálneho povrchu a je 15-krát väčšia ako USA. Počas zimy sa formuje morský ľad a mnoho lodí je tiež vystavených námraze od októbra do mája. Tichý oceán je domovom foriem morského života, ako sú morské levy, morské vydry, tulene, korytnačky a veľryby. Z ekonomického hľadiska ponúka Tichý oceán dostupnú, relatívne nízkonákladovú námornú dopravu, rozsiahle rybárske revíry, ropu a plyn na mori polia, minerály a piesok a štrk pre stavebný priemysel a viac ako 60 percent svetových rýb pochádza z Tichého oceánu Oceán.
Aljašský záliv
Aljašský prúd a Aljašský pobrežný prúd ovládajú Aljašský záliv. Tieto prúdy fungujú ako cesty pre organizmy a zdroje, od ktorých závisia. Niekoľko vstupov, napríklad Cook Inlet a Prince William Sound, chráni organizmy pred silnými prúdmi. Tento záliv obsahuje veľa veľkých ľadovcov a ľadovcov, ktoré sú prenášané do mora silnými prúdmi.
Beringovo more
Beringovo more je jedným z najväčších morských ekosystémov na svete. Nachádza sa medzi Sibírom a Aljaškou. Na severe je Beringovým prielivom spojená s Čukotským morom a Severným ľadovým oceánom; Tichý oceán leží na juh Beringovho mora, okolo Aleutských ostrovov a Aljašského polostrova, z ktorého ostrovy vedú.
V Beringovom mori žije veľa veľkých vtákov a morských živočíchov, ako sú tulene kožušinové a veľryby. Teplota mora sa za posledných 50 rokov zvýšila, čo znížilo početné populácie rýb a morských živočíchov. To znepokojuje ľudí v rybárskom priemysle, pretože toto more bolo jedným z hlavných zdrojov rýb.
Beaufortovo more
Beaufortovo more je severne od Aljašky v Severnom ľadovom oceáne. Názov dostal podľa britského kontradmirála sira Francise Beauforta. More zaberá asi 184 000 štvorcových míľ a priemerná hĺbka je 3 239 stôp, ale klesá až k 15 360 stôp nadol. More je pevne zamrznuté v strednej a severnej oblasti s otvorením pobrežného ľadového obalu v auguste a septembri. Veľryby a morské vtáky sú dve z najbežnejších zvierat, ktoré sa nachádzajú v blízkosti Aljašky v Beaufortovom mori. V roku 1986 sa veľa zásob ropy našlo v zálive Prudhoe na Aljaške, ktorý sa nachádza v tomto mori.
Čukotské more
Čukotské more sa nachádza aj v Severnom ľadovom oceáne, severozápadne od Aljašky. Toto more obsahuje plytké dno, ktoré poskytuje živiny a biotop pre zvieratá, ako sú mrože, ľadové tulene, veľryby, morské vtáky a ľadové medvede. Toto more je domovom desatiny svetovej populácie ľadových medveďov. Meniaca sa klíma, ktorá spôsobuje zvyšovanie teploty, ovplyvňuje populáciu ľadových medveďov, pretože topiaci sa ľad im sťažuje lov potravy. Pretože sa morský ľad stále topí, mnoho ropných a plynárenských spoločností má záujem o vrtné práce v tejto konkrétnej oblasti.