Пептиды - это короткие полимерные фрагменты, состоящие из аминокислот. Каждый пептид имеет определенную аминокислотную последовательность, обозначенную трехбуквенным или однобуквенным кодом; например, аминокислота аланин сокращенно обозначается как «Ala» или «A». Заряд пептидов в растворе зависит от кислотности раствора. Изоэлектрическая точка (pI) относится к значению кислотности раствора, при котором молекула пептида имеет нулевой общий заряд. Растворимость пептида минимальна в изоэлектрической точке. Используйте доступные веб-серверы, чтобы вычислить значение pI для аминокислотной последовательности пептида.
Напишите последовательность пептида, используя однобуквенный код. Например, если пептид имеет аминокислотную последовательность Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (аланин-серин-глюматовая кислота-лейцин-пролин), тогда последовательность из одной буквы - «ASELP». При необходимости обратитесь к таблице преобразования трех букв в одну, приведенную в Ресурсы.
Используйте любой веб-браузер, например Internet Explorer или Firefox, чтобы перейти к серверу, который вычисляет изоэлектрическую точку пептида (pI); см. Ресурсы.
Считайте значение изоэлектрической точки (pI), указанное в строке «Теоретический pI / Mw». В нашем примере pI равен 4,00. Обратите внимание, что сервер также вычисляет молекулярную массу (Mw) пептида.
об авторе
Оксана Фокс - писатель-фрилансер, специализирующаяся на медицине и лечении, компьютерном программном и аппаратном обеспечении, цифровой фотографии и финансовых услугах. В 1988 году окончила Московский медицинский колледж по специальности педиатрия.
Фото Кредиты
Comstock Images / Comstock / Getty Images