O filo chordata representa toda a classe diversa de vertebrados, animais com coluna vertebral, bem como lanceletes e tunicados. Duas estratégias de fertilização são empregadas pelos membros dos cordados: fertilização interna, onde os gametas, ou espermatozóide e óvulo, encontram-se dentro do corpo de um dos pais, e fertilização externa, onde espermatozóide e óvulo se encontram fora do corpo. A fertilização externa é necessariamente limitada aos ambientes aquáticos, uma vez que os espermatozoides precisam de um meio líquido para nadar e chegar ao óvulo.
Subfilo Cephalochordata
Cephalochordata é um subfilo muito pequeno composto por espécies de lanceletes. Lanceletas são pequenos animais parecidos com peixes que representam algumas das características mais primitivas do filo, incluindo uma corda nervosa dorsal suportada por uma notocorda em vez de uma espinha. As fêmeas e os machos produzem óvulos e espermatozóides, respectivamente, a partir de conjuntos de gônadas emparelhadas e os liberam simultaneamente para fertilização durante a estação de desova. Durante a desova, as gônadas das lanceletas se rompem e os gametas são lançados na água. Os gametas fertilizados formam larvas semelhantes a peixes.
Subfilo Urochordata
O subfilo urochordata, também conhecido como tunicados, pode não parecer pertencer ao filo chordata à primeira vista. Eles geralmente têm apenas notocordes nos estágios larvais e os adultos freqüentemente estão completamente imóveis, parecendo-se tanto com plantas quanto com animais. A reprodução do tunicado é um assunto complicado. Alguns tunicados se reproduzem assexuadamente e, dos que se reproduzem sexualmente, a maioria é hermafrodita, produzindo gametas masculinos e femininos. Algumas espécies coloniais retêm óvulos e absorvem esperma através de seu sifão, ou boca, mas espécies solitárias liberam óvulos e espermatozóides para fertilização externa. Os ovos fertilizados formam um girino que nata livremente, que encontra um novo lar e se torna um adulto imóvel.
Subfilo Vertebrata: Peixe
Alguns peixes nascem vivos, mas a maioria usa fertilização externa. O comportamento de reprodução varia entre as espécies, mas geralmente um ou ambos os pais preparam um ninho para os ovos repousarem. Existe um ritual de namoro para garantir que os óvulos e os espermatozoides se encontrem para a fertilização e, então, ambos os indivíduos liberem um grande número de gametas. Algumas espécies continuam a fornecer algum cuidado parental, como choca na boca, onde um dos pais (em algumas espécies é a fêmea; em outras, o macho) permite que os filhotes se abriguem de predadores em sua boca; mas a maioria dos peixes jovens ou alevinos ficam por conta própria.
Subfilo Vertebrata: Anfíbios
Os anfíbios vivem parte de suas vidas na água e parte na terra, mas quase todas as rãs e a maioria dos outros anfíbios usam fertilização externa em ambientes aquáticos para se reproduzir. Seja um lago ou um poço de uma folha, a fêmea e o macho encontram-se em um terreno fértil, onde a fêmea deposita uma massa de ovos e o macho deposita esperma no topo da massa. Os ovos da maioria dos anfíbios se desenvolvem em um estágio larval aquático que sofre metamorfose para um adulto anfíbio.