DNA inneholder kodede instruksjoner som cellene dine trenger for å fungere. I en eukaryot, en organisme med en kjerne i hver av cellene, lagres DNA inne i kjernen, så de instruksjonene må overføres til cellen ved først å lage en kopi av dem i en polymer som kalles messenger RNA eller mRNA. mRNA redigeres av mobilmaskiner før den forlater kjernen, og flere viktige molekylære funksjoner blir lagt til den for å markere den som ferdig og klar til bruk.
Capping mRNA
Den første kjemiske modifikasjonen som alle eukaryote mRNA deler kalles en 5'-hette. RNA-polymeraseenzymet beveger seg langs en DNA-streng som lager en RNA-kopi eller transkripsjon. Slutten av RNA-polymeren der RNA-polymerase begynte å syntetisere, kalles 5'-enden. Tre andre enzymer tilfører en kjemisk gruppe kalt 7-metylguanylat til 5'-enden; denne modifikasjonen kalles en cap. Hvis et mRNA dukker opp i cellen uten et 5'-hette, kan det brytes ned av andre enzymer; instruksjonene den inneholder vil aldri bli oversatt. 5'-hetten markerer mRNA som legitim og beskytter den mot nedbrytning.
Polyadenylering
Den andre universelle modifikasjonen som bare finnes i eukaryot mRNA er en poly-A-hale. 5'-enden av mRNA er der RNA-polymerase startet, og 3'-halen er der den ender. Etter transkripsjon tilfører et enzym kalt poly (A) polymerase hvor som helst fra 100 til 250 ekstra adenosin eller A-underenheter, derav navnet poly A-hale. Denne halen ser ut til å gjøre mRNA mer stabil og markerer den som bestemt for eksport fra kjernen.
Funksjoner for modifikasjoner
5 'caps og poly-A haler finnes i alle eukaryote mRNAer. Imidlertid bruker bakterier og andre prokaryoter også mRNA, men deres mRNA mangler disse to egenskapene. Eukaryotisk mRNA redigeres eller skjøtes noen ganger før den forlater kjernen, så de må regulere hvilke mRNAer som kan forlate kjernen. Videre er oversettelse av instruksjonene kodet i mRNA en mye mer regulert prosess i eukaryoter, og disse modifikasjonene spiller også viktige roller i den prosessen. I motsetning til eukaryoter har prokaryoter ingen kjerne, så det er ikke nødvendig å regulere inn- eller utgang av mRNA - så snart mRNA er transkribert, blir den satt løs i cellen.
Virus og mRNA
Når et virus infiserer en eukaryot celle, trenger patogenet å sikre at vertscellen slutter å produsere sine egne proteiner og begynner å lage virale proteiner og RNA i stedet. Noen av dem som poliovirus og picornavirus bærer et enzym som hakker opp et protein som kreves for å oversette instruksjonene som er lagret i et 5'-avkortet mRNA. Som et resultat blir ingen av cellens egne mRNAer oversatt, og virus-RNA som ikke er avkortet blir oversatt i stedet. Ved å gjøre dette tar de det som kan være et ansvar - deres egen mangel på en 5'-hette - og gjør det til en fordel.