Forskere har evnen til å sekvensere DNA-molekylet; med andre ord, de kan bestemme rekkefølgen av nukleotidbasene i et gitt molekyl. Sekvensering av DNA-molekylet kan være det første av et antall trinn som trengs for å finne ut hvordan det spesifikke nukleotider i et DNA-molekyl samhandler med hverandre og koder for forskjellige egenskaper i et organisme. Prosessen med å sekvensere DNA er ganske involvert, men automatiske DNA-sekvenser minimerer menneskelig involvering som er nødvendig, i det minste en del av prosessen.
Prøveforberedelse
For at en automatisk DNA-sekvensator skal fungere, må den oppdage de fire nukleotidbasene som utgjør DNA: adenin, guanin, tymin og cytosin. Forskere kopierer et stykke DNA mange ganger og bruker restriksjonsenzymer for å kutte DNA i biter av forskjellige størrelser. De tilfører deretter en liten mengde fluorescerende merket base til hvert parti DNA. Basen, som enten er adenin, tymin, guanin eller cytosin, vil binde seg til basekomplementet på enden av en streng. For eksempel vil adenin binde seg til tråder som slutter med tymin, og guanin vil binde seg til tråder som slutter med cytosin.
Automatisk DNA Sequencer-konstruksjon
En automatisk DNA-sequencer er bygget omtrent som en DNA-sequencer som krever mer manuelt arbeid. Spesielt er en automatisk DNA-sequencer en tank, omtrent 1 fot lang, med 96 gelbrønner som DNA kan helles i. I en automatisk DNA-sequencer, som i en hvilken som helst DNA-sequencer, injiseres DNA i gelbrønnene på toppen av tanken, og en negativ ladning påføres den enden av tanken. Den negative ladningen gir en sterk drivkraft for DNA-strengene til å reise forskjellige avstander til enden av tanken.
Automatisk injeksjon
En automatisk DNA-sequencer injiserer batcher av DNA automatisk i toppen av gelen. Som sådan sparer det forskere enorm tid og krefter. Etter at batchene er injisert, påfører sequenceren automatisk en negativ ladning i den ene enden av tanken, noe som får strengene til å migrere varierende avstander gjennom gelen. De forskjellige avstandene gjenspeiler de forskjellige størrelsene på DNA-tråder som går gjennom gelen.
Detektor
Mange automatiske DNA-sekvenseringsmaskiner er satt opp for å oppdage det fluorescerende fargestoffet på DNA-strengene som går gjennom gelen. Ved å gjøre det kan de identifisere nukleotidene som er i endene av trådene og registrere dem i datamaskinen. Imidlertid presenterer sequencere i beste fall en sammenblandet versjon av DNA-nukleotider. Etter å ha brukt en automatisk DNA-sekvenseringsmaskin, må du gjennom en prosess som kalles "etterbehandling", der en kombinasjon av datamaskiner og forskere sorterer ut resultatene fra DNA-strengen som oppdager for å samle dataene til en omfattende beskrivelse av et DNA Strand. Ikke overraskende kan denne prosessen ta mye lenger tid enn selve prosessen med sekvensering.