Haier er kanskje ikke de søteste truede dyrene, men i 2011 er de i trøbbel. Den internasjonale unionen for bevaring av naturen lister opp 143 haiarter som "truet" eller "kritisk truet" "nær truet" eller "sårbar" på sin "røde List, og 210 til, er oppført som "data mangelfull." Mindre enn en fjerdedel av de kjente haieartene i 2011 ble klassifisert som "minste bekymring", som under ingen øyeblikkelig trussel.
Åpent hav
Pelagiske eller oceaniske haier lever i det dype vannet i det åpne havet. Truede pelagiske haier inkluderer den berømte, og dårlig forvrengte, store hvite haien. Også den største haiarten, soling og hvalhaier, er bekymringsfulle. Den mye distribuerte blå haien er tallrik fra 2011, men den er klassifisert som nesten truet fordi omtrent 20 millioner individer blir fanget av menn hvert år. I følge World Wide Fund for Nature utgjør haifinindustrien omtrent halvparten av dette tallet.
Kontinentalsokkel
Kontinentalsokkelen, grensen mellom landmasser og havbassengene, er hjemmet til et stort utvalg av haier. Mange av dem er kjent for å være i fare, inkludert seks arter av de bisarre hammerhaiene og 13 arter av engelhaien. Andre er oppført som data mangelfull.
Kyst
Haier som hyppig kystregioner er sårbare for menneskelige aktiviteter. På grunn av den reelle eller opplevde risikoen for svømmere, er disse haiene noen ganger utsatt for bevisst utryddelsesforsøk. De er også lett tilgjengelige for viltfiskere. Truede kystarter inkluderer den potensielt farlige tigerhaien, et mål for kommersielt fiskeri, viltfiskere og haikontrollprogrammer. Den truede og sårbare listen er også ufarlig (for mennesker) haier som sandtigerhaien.
Havbunn
Benthiske haier, de hvis hjem hovedsakelig er havbunnen, inkluderer flertallet av de mindre haiene som dogfish og catsharks. Lite er kjent om de fleste av disse haiene. For eksempel viser IUCN de fleste kattearter som "data mangelfull", med noen få som er kjent for å være truet.