Akvatiske økosystemer består av samspillende organismer som bruker hverandre og vannet de bor i eller i nærheten av for næringsstoffer og ly. Akvatiske økosystemer er delt inn i to hovedgrupper: marint eller saltvann og ferskvann, noen ganger kalt innlands eller nonsalin. Hver av disse kan deles inn ytterligere, men de marine typene er mer typisk gruppert enn ferskvannsøkosystemene.
Det største økosystemet
Hav er det største av økosystemene og dekker mer enn 70 prosent av jordens overflate. Havets økosystem er delt inn i fire forskjellige soner. Den dypeste sonen i dette marine økosystemet, avgrunnssonen, har kaldt, høyt trykkvann med høyt oksygen men lite næringsnivå. Rygger og åpninger på havbunnen som avgir hydrogensulfid og mineraler finnes i denne sonen. Over avgrunnssonen er den bentiske sonen, et næringsrikt lag som inneholder tang, bakterier, sopp, svamper, fisk og annen fauna. Over dette er den pelagiske sonen, i det vesentlige det åpne hav, som har vann med et bredt temperaturområde, overflate tang og mange fiskearter, samt noen pattedyr. Tidevanns sonen, der havet møter land, er dekket av vann under høyvann og er jordbasert ved lavvann, slik at den kan støtte unik vegetasjon og dyreliv.
Regnskog av havet
Korallrev dekker bare en liten brøkdel av jordens overflate og bare en litt større prosentandel av havbunnen, men støtter mye variert vannliv. Revbyggende koraller finnes bare på grunt subtropisk og tropisk vann. Korallene er vert for fotosyntetisering av alger og får mesteparten av maten fra disse algene, noe som gir nok vekst til å danne store strukturer som skaper verdifulle habitater. Økende vanntemperaturer og økende forsuring av vann knyttet til økning i karbondioksid er de største truslene korallrevene møter. På lokalt nivå truer overhøsting av koraller og overfiske skjær, det samme gjør invasive arter og forurenset avrenning.
Ser på strandlinjer
Som korallrev grupperes elvemunninger noen ganger med hav for å utgjøre det marine økosystemet. Elvemunninger forekommer der saltvann fra havet og ferskvann som strømmer fra elver eller bekker møtes, skaper et unikt habitatorientert rundt vann som har en variert saltkonsentrasjon og har høye nivåer av næringsstoffer som følge av at sedimenter blir avsatt av elver eller bekker.
Innsjøer og dammer
Innsjøer og dammer, vannforekomster med varierte overflatearealer og volumer, er også kjent som lentiske økosystemer og er preget av mangel på vannbevegelse. Som hav, er innsjøer og dammer delt inn i fire forskjellige soner: littoral, limnetisk, dyp og bentisk. Lys trenger inn i det øverste av disse, littoral, som inneholder flytende og rotfestede planter. De andre sonene spiller også hver sin unike rolle i økosystemet.
Strømmende ferskvann
Elver, bekker og bekker er klassifisert som lotiske økosystemer. Disse økosystemene er preget av flytende ferskvann, som beveger seg til en større elv, innsjø eller hav, og er tilstede hele eller hele året. På grunn av vannets bevegelse har elver og bekker en tendens til å inneholde mer oksygen enn deres lentiske slektninger og har vertsarter som er tilpasset det bevegelige vannet.
Våt jord og vannelskende planter
Våtmarker er ferskvannsøkosystemer preget av tilstedeværelse av vann, som kan være flere meter dypt eller bare mette jorden, ofte med sesongmessige svingninger. Visse jordtyper kjent som vannbunn som er forskjellige fra andre jordarter og plantearter tilpasset våte forhold, karakteriserer også våtmarker. Våtmarker er veldig viktige for å regulere vannivået, filtrere vann og forbedre vannkvaliteten, redusere flomfare og gi verdifulle habitater for planter og dyr.