Biomer er biologiske samfunn på jorden klassifisert i henhold til den dominerende vegetasjonen og preget av tilpasninger av organismer til det aktuelle miljøet. Ferskvannsbiomer er preget av det ekstremt lave saltinnholdet i vannet. Abiotiske faktorer er ikke-levende komponenter som danner miljøet der organismene lever i ferskvannsbiomer. Disse inkluderer de kjemiske og fysiske miljøfaktorene som sollys, temperatur, vann eller fuktighet og jord. Ferskvann finnes i innsjøer, dammer, elver og bekker, og biomene opprettholdes av nedbør.
Temperatur
Temperatur spiller en viktig rolle i ferskvannsbiomer. Avhengig av årstid kan temperaturen være jevn eller forskjellig mellom forskjellige lag med dammer og innsjøer. Om sommeren kan temperaturen på toppen være 22 grader C mens bunn temperaturen kan være rundt 4 grader C. Om vinteren kan temperaturen på toppen ligge ved frysepunktet for vann (0 grader C) mens bunnen kan være på 4 grader C. I termoklinen, som er sonen mellom disse to lagene, endres vanntemperaturen kontinuerlig. I løpet av vår- og høstsesongen, på grunn av vind, blandes de øverste og nederste lagene med hverandre, noe som resulterer i en regulering av temperaturen rundt 4 grader C. Denne blandingen resulterer i oksygensirkulasjon gjennom hele innsjøen. Blanding er mindre vanlig om vinteren.
Nedbør
Nedbør er ansvarlig for påfylling av vann i ferskvannsforekomster. Vannkretsløp spiller en viktig rolle i denne forbindelse. Avhengig av størrelse påvirker elver og innsjøer klimaet. De er ansvarlige for tilstedeværelsen av fuktighet i luften. Denne fuktigheten eller vanndampen danner skyer og faller ut over land som regn. Om vinteren kan dette være i form av snø. Nedbør spiller en viktig rolle i vedlikehold og dannelse av ferskvannsbiomer. Mens noe vann eller snø siver ned i bakken for å danne grunnvann, renner gjenværende vann over landoverflaten og flyter tilbake til ferskvannsbiomer.
Vannegenskaper
Vannegenskaper som dybde og hvorvidt vannmassen er statisk (ikke-bevegelig) eller dynamisk (i bevegelse) skiller ferskvannsbiomer. Elver og bekker beveger ferskvann. Yngre elver kutter en rettere og direkte sti gjennom bakken og fjellet. Eldre elver og bekker følger flere kurver, noe som gjør at de flyter langsommere. Vann på innsjøen eller dammen er derimot statisk. Selv om innsjøvann er statisk, beveger det seg og vannbølger dannes på grunn av luftstrøm. Sesongbaserte endringer flytter også vann i sjøen. Om høsten avkjøles overflatevannet og synker. Bunnlagene beveger seg oppover. Dette fenomenet kalles omsetning. Dette regulerer temperaturen i innsjøene.