Begin met het identificeren van onbekende bacteriën door hun fysieke kenmerken te observeren, zoals celwand, vorm en koppelingen. Gebruik standaard laboratoriumprocedures, zoals celkleuring, kweken en DNA-sequencing om uw identificatie verder te verfijnen. Bacteriën worden over het algemeen in soorten gegroepeerd op basis van hun fysieke en metabolische kenmerken, in plaats van hun genetische relaties met elkaar.
Positief of negatief
Eubacteriën zijn de zogenaamde echte bacteriën. Ze onderscheiden zich van archaea of archaebacteria, die een apart koninkrijk vormen. Eubacteriën zijn prokaryoten, wat betekent dat ze geen kernmembraan hebben. De meeste hebben celmembranen en celwanden. Bacteriën met dikke celwanden worden grampositief genoemd omdat ze vatbaar zijn voor afsterven tijdens een test die de Gram-kleuring wordt genoemd. De Gram-kleuring is de eerste test die wordt gebruikt bij de classificatie van bacteriën. Bacteriën met dunne of afwezige celwanden zijn gramnegatief omdat ze de Gramkleurstof niet vasthouden.
Vorming van bacteriën
Bolvormige bacteriën worden cocci genoemd, bacteriën die rechte staven vormen, worden bacillen genoemd en bacteriën met een tussenvorm worden coccobacillen genoemd. Deze kunnen allemaal gramnegatief of grampositief zijn. Stijve, spiraalvormige bacteriën staan bekend als spirilla en zijn alleen gramnegatief. Flexibele, onafhankelijk mobiele, spiraalvormige bacteriën worden spirocheten genoemd en zijn gramneutraal. Ten slotte worden stijve, kommavormige staven vibrios genoemd en zijn gramnegatief. Een paar weinig bekende en slecht begrepen bacteriën hebben verschillende vormen, zoals de stervormige stella en bijlvormige labrys. Er zijn ook twee intermediaire bacteriële groepen. Rickettsia lijkt op virussen, heeft verschillende vormen, is gramnegatief en kan alleen in andere cellen overleven. Mycoplasma, dat vergelijkbaar is met schimmels, heeft geen celwanden en bevat veel soortspecifieke, longontsteking veroorzakende longpathogenen.
Kubussen, clusters en andere koppelingen
Kokken en bacillen worden verder geclassificeerd door de verbindingen die ze vormen na celdeling. Diplococci en diplobacilli plakken in paren aan elkaar. Streptokokken en streptobacillen vormen ketens. Tetrad-kokken blijven in vierkanten van vier bacteriën. Sarcinae cocci vormen kubussen met acht bacteriën en stafylokokken vormen clusters.
De bacterie identificeren
Als u een onbekende bacterie heeft en u wilt deze identificeren, voert u meestal een gramkleuring uit en observeert u het uiterlijk van de kolonie en de individuele kenmerken. Op dat moment kun je zeggen dat je bijvoorbeeld gramnegatieve, aerobe streptobacillen hebt. U kunt uw monster vervolgens vergelijken met verschillende bekende bacteriën door het op verschillende kweekmedia te plaatsen die: de groei van sommige soorten aanmoedigen en andere remmen, of door het monster te testen op verschillende bekende bacteriële bijproducten. Als laatste redmiddel kan DNA-sequencing bepalen of je een bekende of onbekende bacteriesoort of -stam hebt, op voorwaarde dat je het vergelijkt met een soort of stam waarvan het genoom al is gesequenced.