Hoewel natuurlijke krachten een dierenpopulatie kunnen vernietigen of onder druk zetten, hebben de activiteiten van de mens er in toenemende mate toe geleid dat een groot aantal dieren in gevaar is gekomen. Toegegeven, sommige dieren en planten, vooral gedomesticeerde, zoals gewassen, vee en huisdieren, hebben geprofiteerd en zelfs gefloreerd door de veranderingen die de mens in de wereld heeft aangebracht. Sommige dierpopulaties zijn echter onder enorme druk komen te staan als gevolg van deze veranderingen en in sommige gevallen dalen de populaties tot aanzienlijk lagere niveaus. Kleine populaties of organismen met een beperkte verspreiding zijn extreem gevoelig voor de factoren die in gevaar brengen, of men nu vertrouwt op de gewone betekenis van het woord of de definitie van bedreigde diersoorten belichaamd in federale wet.
Verlies van leefomgeving
Een van de belangrijkste oorzaken van bedreigde dieren is het verlies van leefgebied. Hoewel habitat verloren kan gaan als gevolg van natuurlijke krachten (klimaatverschuivingen, geologische veranderingen), is veel van de habitat die tegenwoordig verloren gaat te wijten aan menselijke activiteit. De aanleg van dammen, snelwegen, kanalen, verstedelijking en landbouw hebben een dramatische invloed op de bewoners van inheemse ecosystemen. Zelfs wanneer delen van het ecosysteem intact blijven en "eilanden" creëren, kan de resulterende habitat te klein of te wijd verspreid zijn om een soort te ondersteunen.
Invasieve soorten
Invasieve soorten zijn een van de belangrijkste biotische redenen waarom dieren met uitsterven worden bedreigd. Veel soorten die in een nieuw ecosysteem aankomen, zijn slecht aangepast en sterven snel uit. Sommige soorten zijn echter in staat het ecosysteem te exploiteren ten koste van inheemse organismen. Kleine ecosystemen zoals die op eilanden worden aanzienlijk aangetast door de introductie van invasieve soorten, maar zelfs inheemse continentale en oceanische populaties kunnen worden verwoest door concurrentie of predatie door de indringer.
Overexploitatie van hulpbronnen
Overbevissing van een bepaalde vissoort is een voor de hand liggende en directe oorzaak voor een bedreigd dier. Maar ook andere organismen binnen het ecosysteem kunnen schade ondervinden (of profiteren) van de overexploitatie van een bepaalde soort. Zo leidde de bezorgdheid dat de Californische zeeotter de abalone-populatie verwoestte tot: het willekeurig doden van de zeeotters, waardoor de balans van de biotische concurrentie tussen verschillende organismen. De vermindering van zeeotters leidde tot een explosie van de populatie zee-egels die graasden in het ruim van kelp. Toen de kelp losbrak van de bodem en aanspoelde, kwamen organismen die afhankelijk waren van de kelpbossen onder verhoogde druk te staan.
Pathogenen en ziekten
De verspreiding van gedomesticeerde dieren heeft ook de daarmee samenhangende ziekten naar nieuwe delen van de wereld verspreid. In sommige gevallen besmetten de ziekten inheemse populaties die weinig weerstand hadden tegen de binnendringende ziekteverwekker. Deze ziekten kunnen epidemische niveaus bereiken in de inheemse bevolking, waardoor hun aantal afneemt.
Milieuvervuiling
Vervuiling in vele vormen heeft veel dieren in gevaar gebracht. Pesticiden en andere chemicaliën die in een ecosysteem worden geïntroduceerd, kunnen ongerichte soorten aanzienlijk schaden. DDT dat werd gebruikt om muggen te bestrijden, werd bijvoorbeeld uiteindelijk in verband gebracht met dalingen in de voortplantingssnelheid van vogels. Andere vormen van vervuiling, zoals thermische, licht- en geluidsoverlast, kunnen elk de overlevingskansen van lokale dierpopulaties verminderen.