ゲル電気泳動は、DNAの鎖を測定および分類するために実験室で使用される方法です。 ほとんどの顕微鏡で見た場合でも、通常の状態ではDNAが小さすぎて操作できないため、これが必要です。 ゲル電気泳動ラボは比較的簡単な手順を使用しており、同じ基本的な手法を使用して個々のタンパク質を分離することもできます。
ゲルマトリックス
ゲル電気泳動手順を開始するには、最初にゲルを作成する必要があります。 通常、ゲルはアガロースと呼ばれる物質を使用して薄いシートで作られます。 粉末状のアガロースをフラスコに入れ、続いて緩衝液と呼ばれる塩水溶液を入れます。 このアガロースとバッファーの混合物は、2つの物質が溶けるまで加熱され、成形型に注がれます。 次に、ゲルが冷える前に、コームと呼ばれる装置が型の一端に配置されます。 ゲルが冷却されると、コームが取り外され、DNAサンプルを保持するために使用される小さなスロットが残ります。
冷却されたアガロース混合物(ゲルマトリックスと呼ばれる)の特別な特徴は、それが塩水で作られるという事実に由来します。 帯電すると、マトリックスは導電性になり、その長さに沿って電気が流れるようになります。 ゲルマトリックスのもう1つの特別な特性は、規則的な微細な穴の存在です。 これらの穴は、DNAの鎖がゲルマトリックスを通って移動することを可能にし、選別プロセスを容易にします。
電気泳動チャンバー
次のステップは、電気泳動チャンバーを作成することです。 これは小さな長方形の箱で、両端にプラスとマイナスの電気接続が配線されています。 チャンバーは通常浅く、卓上に収まるほど小さく、プレキシグラスのような透明な素材で作られています。
電気泳動チャンバーの底に食塩水を注ぎ、ゲルマトリックスをこの溶液にわずかに沈めます。 塩水は、電気の流れを助けることと、ゲルマトリックスを湿らせておくことの2つの目的を果たします。 DNAは負の電荷によって推進されるため、サンプルが負の電気接続の隣に配置されるようにマトリックスを配置します。
DNAの準備
次に、DNAサンプルが準備されます。 溶液中のDNAはほとんど見えないため、個々のサンプルにはローディングバッファーと呼ばれる着色剤が添加されています。 この薬剤はまた、DNA溶液を濃くし、流動性を減らし、より実用的にします。 ピペットを使用して、DNA溶液のサンプルをゲルマトリックスの各交互スロットに移します。 各サンプル間の空のスロットに、実験の制御と比較のために、長さがすでにわかっているDNAの溶液(DNA標準と呼ばれる)を配置します。
電源を入れます
次に、電気泳動チャンバーの電源を入れます。 負のパワーの下では、DNAサンプルはチャンバーの長さ全体に押し出されます。 DNAの小さな鎖は、ゲルマトリックス内をより速く移動し、短時間で、より長く、より遅い鎖から分離します。 着色剤の染料は、DNAの軌跡をたどることができます。 DNAの個々の鎖を見ることができませんが、同じ長さの鎖は一緒に凝集します。
最終ステップ
DNAが選別されると、マトリックスは電気泳動チャンバーから取り出されます。 次に、DNAを染色して、測定と検査を容易にします。