系統樹の作り方

系統樹は、生物が共通の祖先からどのように分岐した可能性があるかを示す進化的関係のグラフィック表現です。 以前は、これは生物や化石の解剖学と生理学の比較を通じて行われていましたが、現在ではDNAヌクレオチド配列から取得した遺伝子情報が一般的に使用されています。 類似性がほとんどない生物は、系統樹の別々の「枝」にあり、特定の共通点がある生物は、同じ枝の「小枝」にあります。 系統樹は、生物の種と進化の変化を理解するための方法です。

関係比較のためにモデル生物を選択します。 これは、生物を表す種、品種、またはヌクレオチド配列を使用して行うことができます。 例の生物は牛である可能性があります。 木の残りの部分は、遺伝的特性に基づいて、牛が他の生物とどれほど密接に関連しているかを示します。

外群を選択します。 外群は、あまり関連性のない生物または大きく異なるヌクレオチド配列です。 モデル生物が牛である場合、考えられる外群は魚です。 2つの生物が異なるほど、系統樹のさらに下に分岐点があります。 時間は、チャートの下部に最も古い日付で表され、チャートの上部に現在の日付が表示されます。 枝の配置は、過去に進化の特徴が祖先の生物を異なる種に変えた可能性がある時期をほぼ示しています。

比較に使用する一連の特性を決定します。 例としては、「4本の足がある」、「かみ砕く」、「胎生を与える」、「髪を育てる」などがあります。 ヌクレオチド配列はただです 特性を決定するDNAのアルファベット順の表現であるため、別のオプションは次のようになります。 ATGGACACGGA。」

特性に基づいて生物を分割します。 1つの生物に目的の特性が含まれていない場合、系統樹に分岐が作成されます。 特徴的な「4本の足がある」ため、牛、羊、鹿はすべて1つの枝にあり、魚は別の枝にあります。 ポスターボードの上隅に牛​​の絵またはシーケンスを貼り付け、反対側の隅に魚を貼り付け、それらから交差するV字型で紙の底に2本の線を引きます。

各例が枝から小枝への単一の分離を持つまで、モデル生物またはヌクレオチド配列を分離し続けます。 特徴的な「羊毛を持っている」とは、羊を鹿や牛から分離して単一の枝にします。 羊の画像を魚の画像の近くに置き、V字型に牛の枝につながる線を引きます。 「ふわふわのしっぽがある」という特徴を利用することで、牛と鹿の境界を定めることができます。 牛と羊の間に鹿の絵を貼り付け、魚と羊の線の上で交差するV字型に別の線を描きます。 各種に単一の枝がある場合、系統樹は完成しています。

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