חיידקים הם קבוצה גדולה של מיקרואורגניזמים שנמצאים בבתי גידול שונים. חיידקי הפה הם אלה הקיימים בפה של בעלי חיים חיים, כולל בני אדם. הם יכולים להיות טורפים, מוטליסטים ופתוגנים, תלוי בסוג הקשר שנוצר עם אורגניזמים אחרים. חיידקי לשון פתוגניים גורמים לזיהומים רבים דרך הפה, כולל ריח רע מהפה, מחלות חניכיים, פלאק והידרדרות בשיניים. הם מטופלים על ידי אנטיביוטיקה, נהלים עקביים של היגיינת הפה, כולל שימוש בחוט דנטלי וצחצוח קבוע, וגרגור במי פה חיטוי.
ויילונלה
הסוג Veillonella, השייך למשפחת החיידקים Veillonellaceae, מורכב מגדול קבוצה של מינים שוכני לשון, כולל Veillonella לא טיפוסי, Veillonella dispar ו- Veillonella פרווולה. הם חיידקים אנאירוביים בצורת עגול אשר מטבוליזם חומצת חלב המיוצרת על ידי חיידקים אוראליים אחרים, אשר פועלת לאחר מכן על עששת ורובד. פרילית Veillonella נחשבים אורגניזמים מועילים. על פי "המיקרוביולוגיה הרפואית" של רוזנטל ופפלר, הסוג נקרא על שם A. וילון, בקטריולוג צרפתי שבודד לראשונה את המין.
טרפונמה דנטיקולה
טרפונמה דנטיקולה הוא חיידק פתוגני אנושי השייך למשפחת החיידקים Spirochetes. הוא אנאירובי, סלילי, דק, ניוד וגמיש. החיידק נע על ידי פלאגלה, שהם מבנים הגורמים לכוח המניע באמצעות דחיפה. טרפונמה דנטיקולה הוא תושב נפוץ בחלל הפה האנושי ונמצא בשפע ברובד דנטלי ומעל פני הלשון. הצטברותו גורמת למחלות חניכיים, שמבעירות את רקמות החניכיים, מגבילות את ספיגת התזונה על ידי העצמות ובסופו של דבר מובילות לאובדן שיניים. טרפונמה דנטיקולה ידועה כגורמת להליטוזיס, או ריח רע מהפה. הליטוזיס נגרם על ידי הצטברות תוצרי הלוואי של חילוף החומרים של החיידקים וחיידקים גוססים. תוצרי לוואי אלה כוללים מוקינים ופפטידים, חלבונים מותססים, נוזל סדק אוראלי ומזון שיורי. בנוסף, טרפונמה דנטיקולה מפרישה תרכובות מזונות בחלל הפה, כולל מתיל מרקטן, תרכובות גופרית נדיפות ודימתיל סולפט.
Fusobacterium Nucleatum
Fusobacterium nucleatum נמצא בפה האנושי, בדרך כלל על הלשון, וגורם למחלות חניכיים. זהו אנאירובי, בצורת מוט ולא מתפתח. ל- Fusobacterium nucleatum חמישה תת-מינים: Fusobacterium animalis, Fusobacterium fusiforme, Fusobacterium vincentii, Fusobacterium nucleatum ו- Fusobacterium polymorphum. על פי "המיקרוביולוגיה החיונית לרפואת שיניים" של Samaranayake, Fusobacterium nucleatum גורם לתעוקת חזה של וינסנט, למעי הגס או לדלקת חניכיים כיבית חריפה. ניתן לנהל את זה ביעילות על ידי מי פה חיטוי והיגיינת פה טובה.