המשקעים המרכיבים את האקוויפרים חייבים להיות חדירים ונקבוביים, ומאפשרים למים לעבור דרכם. מים מאקוויפר הם בדרך כלל נקיים ביותר, מכיוון שהמשקעים העדינים לוכדים חלקיקים וחיידקים, ומשמשים כמסנן טבעי. המשקעים הנוטים לייצר את האקוויפרים הטובים ביותר כוללים אבן חול, גיר, חצץ ובמקרים מסוימים גם סלע וולקני שבור.
אבן חול
למרות שהחול נקבובי מאוד, ברגע שהוא נדחס ומובט לסלע הוא מאבד הרבה משטח הנקבוביות שלו. עם זאת, מי תהום עדיין יכולים להיות מועברים באמצעותם מפרקים ושברים. אבן חול יכולה להיות גדולה מאוד מכיוון שמיטות אבן חול יכולות להתפשט על פני שטחים נרחבים. רבים מאקווי-מים מאבני החול בארצות הברית מוטבעים בפצלי אבן סיד. כתוצאה מכך, המים באקוויפרים אלו נחשבים במצב מוגבל מכיוון שהסלע שמסביב אינו חדיר.
אֶבֶן גִיר
אבן גיר היא הסוג הנפוץ ביותר של אקוויפר סלעי פחמתי. רבים מהם מתחילים כמשקעים בסביבות ימיות לשעבר, שם המשקעים מצטמצמים וקומפקטיים. הסדקים והמפרקים באבן גיר נוצרים בדרך כלל כאשר הסלע מתמוסס באטיות במים חומציים מעט, ומשאיר מקומות לזרמת מי תהום. לפעמים נוצרות מערות המחזיקות מים ומשתרעות על אלפי מטרים. לעתים קרובות, הסדקים והמפרקים באבן גיר מהווים רשת מחברת, המשפרת עוד יותר את זרימת המים.
חָצָץ
חצץ יוצר אקוויפר טוב מכיוון שהוא חדיר ונקבובי במיוחד. חלקי המשקע הגדולים יוצרים חללי נקבוביות משמעותיים שהמים יכולים לעבור דרכם. לעתים קרובות, חצץ חייב להיות מוקף בסוג אדמה פחות חדיר, כגון חימר עשיר או סלע בלתי חדיר. אולם כאשר מלט חצץ הוא מתאגד ומאבד מחדירותו.
סלעים געשיים שבורים
במקרים מסוימים, סלעים געשיים שבורים, כמו בזלות עמודים, הופכים לאקוויפרים טובים. אזורי הריסות מקיפים הרי געש ומורכבים מחלקיקים גדולים, שכמו חצץ הם נקבוביים וחדירים מאוד. השונות בין משקעי סלע וולקניים נובעת בעיקר מסוג המשקעים הספציפי ומהאופן בו הוא נפלט. לסלעים פירוקלסטיים יש חדירות גבוהה ונקבוביות גדולות. זרמים בזלתיים הם בדרך כלל נוזלים ויש בהם חללי נקבוביות גדולים המאפשרים לעבור מים.
