Come ottenere una sequenza di tRNA da una sequenza di DNA

Il processo di produzione di proteine ​​da una sequenza di DNA - acido desossiribonucleico - comprende due fasi principali: trascrizione e traduzione. Durante la trascrizione, dal modello di DNA viene creato un acido ribonucleico messaggero, o mRNA. Questo mRNA si combina con un RNA ribosomiale, noto come rRNA, e l'RNA di trasferimento, o tRNA, complesso per tradurre il codice dell'mRNA in una sequenza di amminoacidi, una proteina. Il DNA è costituito da una sequenza di basi nucleotidiche. Le quattro basi sono adenina, timina, guanina e citosina. La sequenza in cui queste basi si verificano su un filamento di DNA alla fine codifica per la produzione di determinate proteine. Dopo che la cellula ha prodotto le proteine, queste possono essere utilizzate strutturalmente o in vari processi metabolici.

Creare una trascrizione mRNA della sequenza di DNA. Ogni base nel DNA corrisponde a un'altra base. Le immagini del DNA lo mostrano tipicamente in una doppia elica, con le basi su un filo che si collegano tramite legami alle basi complementari sul filo opposto. Basi complementari sono: adenina (A) e timina (T), citosina (C) e guanina (G). Quindi se un filamento di DNA legge A-C-G-C-T-A, allora il filamento complementare è T-G-C-G-A-T. Puoi trovare la sequenza del trascritto dell'mRNA allo stesso modo, usando i complementi delle basi mostrate nella sequenza del DNA. L'RNA, tuttavia, non contiene la base timina (T); invece, questa base viene sostituita con l'uracile (U). Quando incontri un'adenina (A) nella sequenza del DNA, abbinala con un uracile (U).

Se la sequenza del DNA è A-A-T-C-G-C-T-T-A-C-G-A, allora la sequenza dell'mRNA è U-U-A-G-C-G-A-A-U-G-C-U.

Crea una sequenza anti-codone di tRNA dalla trascrizione dell'mRNA. Ogni tRNA ha una serie di tre basi note come anticodone. L'anti-codone corrisponde alle basi complementari nella sequenza dell'mRNA. Per determinare la sequenza anti-codone complessiva che corrisponderà a un filamento di mRNA, è sufficiente ritrascrivere la sequenza di RNA; in altre parole, scrivi le basi complementari. Usando la sequenza di mRNA precedentemente annotata, la sequenza anti-codone del tRNA è A-A-T-C-G-C -U-U-A-C-G-A.

Rompi la sequenza di tRNA che hai trovato in set di tre basi. Poiché gli anticodoni sono costituiti da tre basi alla volta, un modo migliore per scrivere la sequenza anticodone A-A-T-C-G-C -U-U-A-C-G-A è AAT-CGC-UUA-CGA.

Suggerimenti

  • Puoi trovare la sequenza anticodone ancora più rapidamente semplicemente scrivendo la sequenza del DNA, usando U per l'uracile al posto di T per la timina. Quindi dividere la sequenza nei tre anticodoni di base.

    È possibile utilizzare la sequenza anticodone da abbinare alle proteine ​​aggiunte da ciascun tRNA durante la traduzione, creando una sequenza di amminoacidi. Verifica, tuttavia, che la tabella di riferimento degli aminoacidi che usi sia per gli anticodoni (vedi Risorse). Molti grafici di sequenziamento degli amminoacidi elencano semplicemente i codoni di mRNA corrispondenti invece degli anti-codoni di tRNA, consentendo di saltare il passaggio della determinazione della sequenza anticodone.

    La sequenza della molecola di tRNA è semplicemente una trascrizione dell'RNA della sequenza di DNA utilizzata per crearla.

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