Perbedaan Ekstraksi DNA Genom Antara Hewan & Tumbuhan

Struktur DNA untai ganda bersifat universal di semua sel hidup, tetapi perbedaan terjadi pada metode ekstraksi DNA genom dari sel hewan dan tumbuhan. Meskipun DNA genomik hidup dalam inti sel, jumlah dan kemurnian DNA yang diekstraksi tergantung pada jenis dan ukuran sel. Misalnya, sel-sel tertentu mengandung lebih banyak DNA dan kotoran daripada yang lain. Baca terus untuk mengetahui lebih lanjut tentang perbedaan ekstraksi DNA.

Jika Anda memperlakukan sel tumbuhan dan hewan dengan zat sabun, itu akan menurunkan lipid dalam sel dan membran inti. Kemudian, campuran DNA akan terpisah dari membran sel dan protein. Selanjutnya, Anda dapat menggunakan alkohol untuk mengendapkan DNA dalam larutan. Tergantung pada jumlah sampel, DNA dapat terlihat dengan mata telanjang. Namun, perlu diingat bahwa prosedur sederhana ini tidak serta merta menghasilkan DNA dengan kemurnian tinggi.

Sel tumbuhan berbeda dari sel hewan karena dinding selnya yang kaku dan organelnya seperti kloroplas. Mereka juga mengandung protein dan enzim yang berperan dalam fotosintesis. Beberapa sel tumbuhan memiliki poliploidi, artinya mereka memiliki lebih dari satu salinan setiap kromosom per sel. Selain itu, proses seluler yang terjadi pada tumbuhan seperti fotosintesis menghasilkan berbagai metabolit sekunder. Sel hewan tidak memiliki dinding sel, tetapi masih membutuhkan bahan kimia seperti sodium dodecyl sulphate (SDS) untuk mengganggu membran sel untuk melepaskan DNA genom.

DNA genom tanaman lebih sulit diekstraksi karena dinding sel tanaman. Anda dapat menghilangkannya dengan homogenisasi atau dengan menambahkan selulase untuk mendegradasi selulosa yang membentuk dinding sel. Selain itu, metabolit yang ada dalam sel tumbuhan dapat mengganggu ekstraksi DNA genom dengan mencemari sampel DNA selama proses pengendapan.

Leukosit darah tepi merupakan sumber utama DNA genomik hewan, tetapi pengambilan sampel sulit dilakukan karena darah harus berasal langsung dari hewan. Darah mengandung berbagai senyawa seperti protein, lipid, sel darah putih, sel darah merah, trombosit dan plasma, yang dapat mencemari sampel DNA. Namun, kontaminan utama DNA hewan yang diekstraksi dari sampel darah adalah heme, yang merupakan komponen non-protein hemoglobin.

Perbedaan antara DNA tumbuhan dan hewan terletak pada urutan basa dalam heliks. Senyawa yang ditemukan dalam sel tumbuhan tidak ada dalam sel hewan, dan urutan basa DNA mencerminkan hal ini. Juga, DNA tanaman genom seringkali lebih besar dari DNA hewan. Perbedaan ini juga mempengaruhi metode ekstraksi, hasil dan kemurnian DNA.