Une fois que vous avez analysé des échantillons d'ADN sur un gel d'agarose et pris une photo, vous pouvez enregistrer la photo pour plus tard, après quoi vous pouvez analyser les résultats et les interpréter. Le genre de choses que vous recherchez dépendra de la nature de votre expérience. Si vous faites des empreintes génétiques, par exemple, vous voudrez comparer la taille des morceaux d'ADN de deux échantillons - du suspect et d'un échantillon de scène de crime, peut-être. Si vous travaillez avec des plasmides de bactéries, en revanche, vous devrez peut-être vous assurer que le plasmide contient l'insert. Par conséquent, la façon dont vous interprétez votre gel dépendra en partie de l'expérience que vous avez faite. Néanmoins, il existe des règles générales que vous pouvez appliquer.
Notez que vous pouvez ou non avoir besoin d'utiliser les instructions de cette section. L'électrophorèse sur gel d'agarose est souvent utilisée pour confirmer qu'un plasmide contient un insert donné. Si vous ne travaillez pas avec des plasmides, vous pouvez ignorer cette section. Si vous êtes, cependant, vous pouvez suivre ces instructions.
Notez que si vous travaillez avec des plasmides non coupés ou entaillés, vous ne pouvez pas estimer la taille en utilisant la procédure de la section 1 ci-dessus. C'est parce que les plasmides non coupés et entaillés migrent à des vitesses différentes de l'ADN linéaire.
Comparez le nombre de bandes dans chaque voie. Rappelons qu'une enzyme de restriction coupe l'ADN aux sites où se trouve une séquence donnée appelée site de restriction. Si un échantillon a été traité avec DEUX enzymes de restriction, une bande pour l'insert et une bande pour le reste du plasmide doivent toutes deux être présentes. C'est parce que l'insert sera flanqué de deux sites de restriction, chacun pour une enzyme différente, donc des coupures sur ces deux sites libéreront l'insert du plasmide. Une coupure à un seul site, en revanche, convertira le plasmide en ADN linéaire. Un échantillon coupé sans enzymes de restriction ou une enzyme de restriction doit alors comporter une seule bande, tandis qu'un échantillon coupé avec deux enzymes de restriction doit comporter deux bandes.
Recherchez les bandes créées par l'ADN plasmidique entaillé. Un plasmide entaillé a une coupure dans un seul brin seulement, il migre donc plus lentement qu'un plasmide coupé. Les plasmides coupés migrent à leur tour plus lentement que l'ADN non coupé.
Estimez la taille de l'insert en utilisant la procédure décrite dans la section 1 et déterminez s'il correspond à vos attentes (qui varieront en fonction de l'expérience.)
Choses dont vous aurez besoin
- Crayon
- Papier
- Tableur
- Photo de votre gel
- Règle