Commencez le processus d'identification des bactéries inconnues en observant leurs caractéristiques physiques, telles que la paroi cellulaire, la forme et les liaisons. Utilisez des procédures de laboratoire standard, telles que la coloration cellulaire, la culture et le séquençage de l'ADN pour affiner davantage votre identification. Les bactéries sont généralement regroupées en espèces en fonction de leurs caractéristiques physiques et métaboliques, plutôt que de leurs relations génétiques entre elles.
Positif ou négatif
Les eubactéries sont les soi-disant vraies bactéries. Ils sont distincts des archées ou des archébactéries, qui forment un royaume séparé. Les eubactéries sont des procaryotes, ce qui signifie qu'elles n'ont pas de membrane nucléaire. La plupart ont des membranes cellulaires et des parois cellulaires. Les bactéries avec des parois cellulaires épaisses sont appelées Gram-positives car elles sont susceptibles de mourir lors d'un test appelé coloration de Gram. La coloration de Gram est le premier test utilisé dans la classification bactérienne. Les bactéries avec des parois cellulaires minces ou absentes sont gram-négatives car elles ne piègent pas le colorant de Gram.
Façonner les bactéries
Les bactéries sphériques sont appelées cocci, les bactéries qui forment des bâtonnets droits sont appelées bacilles et les bactéries de forme intermédiaire sont appelées coccobacilles. Ceux-ci peuvent tous être gram-négatifs ou gram-positifs. Les bactéries rigides en forme de spirale sont appelées spirilles et ne sont que gram-négatives. Les bactéries flexibles, indépendamment mobiles, en forme de spirale sont appelées spirochètes et sont Gram neutres. Enfin, les bâtonnets rigides en forme de virgule sont appelés vibrions et sont à Gram négatif. Quelques bactéries peu connues et mal comprises ont des formes différentes, comme l'étoile en forme d'étoile et les labrys en forme de hache. Il existe également deux groupes bactériens intermédiaires. Les rickettsies sont similaires aux virus, ont une variété de formes, sont gram-négatives et ne peuvent survivre qu'à l'intérieur d'autres cellules. Les mycoplasmes, qui sont similaires aux champignons, n'ont pas de parois cellulaires et comprennent de nombreux agents pathogènes pulmonaires spécifiques à l'espèce et responsables de la pneumonie.
Cubes, clusters et autres liens
Les cocci et les bacilles sont en outre classés par les liaisons qu'ils forment après la division cellulaire. Les diplocoques et les diplobacilles se collent par paires. Les streptocoques et les streptobacilles forment des chaînes. Les coques tétrades restent en carrés de quatre bactéries. Les cocci sarcinae forment des cubes de huit bactéries et les staphylocoques forment des amas.
Identifier la bactérie
Si vous avez une bactérie inconnue et que vous souhaitez l'identifier, vous effectuerez généralement une coloration de Gram, puis observerez l'apparence de la colonie et les caractéristiques individuelles. À ce stade, vous pouvez dire que vous avez, par exemple, un streptobacille aérobie gram-négatif. Vous pouvez ensuite comparer votre échantillon à diverses bactéries connues en le plaçant sur différents milieux de culture qui encourager la croissance de certaines espèces et inhiber d'autres, ou en testant l'échantillon pour différentes bactéries connues sous-produits. En dernier recours, le séquençage de l'ADN peut déterminer si vous avez une espèce ou une souche bactérienne connue ou inconnue, à condition de la comparer à une espèce ou une souche dont le génome a déjà été séquencé.