Les champignons sont des cellules microscopiques qui se développent généralement sous forme de longs fils ou brins appelés hyphes, qui se frayent un chemin entre les particules de sol, les roches et les racines. Ils sont étroitement liés aux animaux et aux plantes et existent depuis environ un milliard d'années. Les humains partagent environ 80% de leurs gènes avec des champignons, ce qui signifie que votre voisin et votre champignon de jardin peuvent avoir plus en commun qu'il n'y paraît.
Au moins 70 000 espèces distinctes de champignons du sol ont été identifiées dans le monde. Ceux-ci peuvent être divisés taxonomiquement en quatre groupes: Zygomycota, Ascomycota, Basidiomycota, et Deutéromycota. Cependant, il est peut-être plus facile pour les observateurs quotidiens de les considérer en fonction de leur fonction et de leurs propriétés métaboliques.
Champignons saprophytes
Les champignons saprophytes sont des décomposeurs. Les saprophytes fongiques décomposent la cellulose et la lignine présentes dans le sol pour produire de l'énergie. Les sous-produits métaboliques de ce processus comprennent le dioxyde de carbone, ou CO
Les champignons saprophytes peuvent pousser dans une grande variété d'endroits en raison de la nature répandue des substances dont ils se nourrissent. Certains champignons saprophytes sont appelés « champignons à sucre » car ils utilisent les mêmes substrats que de nombreuses bactéries.
Champignons mutualistes
Les champignons mutualistes sont également appelés champignons mycorhiziens. Ces champignons du sol colonisent les racines des plantes et sont dits "mutualistes" car les champignons tirent profit de la présence des plantes et vice versa. En échange d'atomes de carbone de la plante, les champignons mycorhiziens aident à faciliter l'absorption du phosphore par les plantes, et ils apportent également d'autres éléments nutritifs du sol, notamment de l'azote, des micronutriments et de l'eau aux plantes sur lesquelles ils sont ancré.
Les champignons mutualistes comprennent deux groupes principaux. L'une d'elles est l'ectomycorhize, qui pousse à la surface des racines des plantes et est fréquemment observée sur ou à proximité des arbres. Le deuxième grand groupe, les endomycorhizes, poussent à l'intérieur plutôt que sur les cellules racinaires des plantes et sont généralement associés aux graminées, aux cultures en rangées, aux légumes et aux arbustes de tous les jours.
Champignons pathogènes
Aussi appelés champignons parasites, ces champignons, à l'opposé des mutualistes, entraînent une réduction de la production végétale voire la mort des plantes lorsqu'ils colonisent les racines ou d'autres organismes du sol. Les champignons pathogènes des racines causent des pertes économiques annuelles importantes dans les activités agricoles humaines. Cependant, bon nombre de ces champignons peuvent aider à contrôler les maladies lorsqu'ils sont correctement déployés. Par exemple, les champignons pièges à nématodes parasitent les nématodes pathogènes, ou vers ronds, tandis que les champignons qui tirent leur énergie des insectes peuvent être utilisés comme agents antiparasitaires.
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