Les agents pathogènes sont des microbes qui causent des maladies chez leurs hôtes. Alors que les plantes ont généralement plus à craindre des champignons pathogènes du sol que des maladies bactériennes du sol, une variété de bactéries pathogènes qui vivent dans le sol provoquent également des maladies chez les plantes. Il existe trop d'espèces d'agents pathogènes des plantes du sol pour les énumérer toutes, mais voici quelques-unes des plus importantes ou des plus courantes. Quelques espèces de bactéries présentes dans le sol peuvent également s'avérer dangereuses, voire mortelles pour l'homme.
Clostridium botulinum
C. botulinum est une bactérie à Gram positif (c'est-à-dire une bactérie dont le test de coloration de Gram est positif) qui forme des spores résistantes et durables. Lorsque les spores trouvent les bonnes conditions, elles germent et commencent à se développer. Ils peuvent produire une protéine mortelle appelée toxine botulique, qui agit sur le système nerveux chez l'homme et d'autres mammifères pour bloquer la libération d'un neurotransmetteur clé appelé acétylcholine. C. Les spores botuliques se trouvent dans le sol et l'eau dans de nombreuses régions du monde. Ils sont anaérobies et ne se développent qu'en l'absence d'oxygène; les conditions acides inhibent leur croissance. Bien que C. botulinum provoque parfois des cas mortels d'une maladie d'origine alimentaire appelée botulisme, la puissante toxine produite par le La bactérie est également devenue utile pour paralyser le tissu musculaire chez l'homme dans le cadre de divers traitements médicaux ou cosmétiques. procédures. Lorsqu'elle est utilisée comme agent thérapeutique, la toxine botulique est connue sous son nom commercial, Botox.
Erwinia carotovora
E. carotovora est un agent pathogène hautement destructeur qui provoque des maladies dans un large éventail de plantes, y compris les pommes de terre et la plupart des autres légumes charnus. Cette bactérie gram-négative en forme de bâtonnet peut envahir les cultures au champ ou pendant le stockage. La sous-espèce E. carotovora carotovora survit bien dans le sol et les eaux de surface; il peut pousser dans les zones racinaires de nombreuses autres cultures non hôtes ou même d'espèces de mauvaises herbes, envahissant les pommes de terre ou d'autres cultures vulnérables lorsque l'occasion s'en présente. Les maladies courantes de la pomme de terre causées par E. carotovora comprennent la jambe noire, la pourriture aérienne de la tige et la pourriture molle des tubercules.
La gale à Streptomyces
Streptomyces scabies est une bactérie à Gram positif qui, avec deux autres espèces de Streptomyces (S. acidiscabies et S. turgidiscabies) peuvent infecter les pommes de terre et autres plantes-racines comme les betteraves, les radis, les navets, les carottes et les panais. Il est inhabituel en ce qu'au fur et à mesure de sa croissance, les cellules forment des filaments similaires à ceux formés par les champignons, bien que beaucoup plus petits. Filaments de S. la gale peut alors se détacher pour former des spores. Les bactéries se propagent en envahissant les tissus jeunes et frais et en pénétrant dans les tissus plus anciens par le biais de plaies ou d'ouvertures naturelles.
Xanthomonas
Xanthomonas est un genre qui comprend de nombreux phytopathogènes importants. Bien qu'elles ne persistent pas très longtemps dans le sol, certaines espèces peuvent survivre dans le sol pendant l'hiver et infecter une nouvelle culture au printemps. Comme toutes les autres protéobactéries, elles sont gram-négatives. L'espèce X. campestris provoque la pourriture noire dans une grande variété de plantes et est peut-être le membre le plus important du genre. Ironiquement, la même bactérie est cultivée commercialement pour produire de la gomme xanthane, un additif alimentaire courant.