Οι σχέσεις μεταξύ διαφορετικών ζώων δημιουργούνται μέσω της ταξινομίας. Η ταξινομία είναι η ταξινόμηση των ζωντανών πραγμάτων. Αυτές οι ταξινομήσεις κατανέμονται ως εξής από τη μεγαλύτερη ομαδοποίηση σε ένα μεμονωμένο είδος ζώου: Βασίλειο, φύλο, υποφύλιο, τάξη, τάξη, οικογένεια, γένος, είδη. Τα ζώα που ανήκουν στο ίδιο είδος είναι πολύ στενά συνδεδεμένα και τα ζώα στο ίδιο βασίλειο σχετίζονται πολύ από απόσταση Για παράδειγμα, όλα τα ζώα ανήκουν σε ένα βασίλειο, τα Animalia και όλα τα φυτά βρίσκονται στο βασίλειο Plantea.
Όλες οι αράχνες και τα καβούρια βρίσκονται στο φυλό Arthopodia, όπως και όλα τα έντομα. Τα αρθρόποδα διακρίνονται φυσικά από το γεγονός ότι όλοι έχουν τεμαχισμένα, αρθρωμένα πόδια και έχουν εξωσκελετό. Ενώ και τα καβούρια και οι αράχνες ομαδοποιούνται στο ίδιο φύλο, αυτό δεν σημαίνει ότι είναι απαραίτητα στενά συνδεδεμένα. Για παράδειγμα, όλα τα ζώα με σπονδυλική στήλη βρίσκονται στο φύλο Cordata. Είναι όμως σαφές ότι αν και τα ψάρια και οι μαϊμούδες έχουν και τα αγκάθια, είναι πολύ διαφορετικά.
Ο διαχωρισμός μεταξύ των αραχνών και των περισσότερων καβουριών συμβαίνει στο επίπεδο του υποφυλίου. Οι αράχνες βρίσκονται στο υποφύλιο Cheilcerata, ενώ τα περισσότερα καβούρια βρίσκονται στο υποφύλιο Mandibulata. Η διαφορά είναι σε μεγάλο βαθμό ότι τα καβούρια έχουν μια κάτω γνάθο, έναν τύπο γνάθου και οι αράχνες έχουν χηλικά, που είναι μέρη του στόματος που εμφανίζονται πριν από το στόμα. Οι «κυνόδοντες» των αραχνών είναι τα χελικά.
Τα καβούρια του πέταλου βρίσκονται στο ίδιο υποφύλιο με τις αράχνες, Cheilcerata. Αυτό κάνει τα καβούρια πέταλου να συνδέονται στενότερα με τις αράχνες από ότι ακόμη και με άλλα καβούρια. Όπως οι αράχνες, τα καβούρια του πέταλου δεν έχουν γνάθο και έχουν χελικέρες μπροστά από τα μέρη του στόματος τους. Οι αράχνες και τα καβούρια πετάλου χωρίζονται στο επίπεδο της κατηγορίας. Οι αράχνες είναι στην τάξη Αραχνίδα, ενώ τα καβούρια πετάλου είναι στην κατηγορία Μεροστομάτα.
Ένα άλλο πλάσμα με καβούρια υπήρχε και ταξινομείται επίσης στο υποφύλιο Cheilcerata. Αυτά ονομάζονται «θαλάσσιοι σκορπιές». Έχουν εξαφανιστεί πριν από 250 εκατομμύρια χρόνια. Αυτοί οι «σκορπιοί» είχαν ένα μεγαλύτερο τσίμπημα στο πίσω μέρος της ουράς τους και μεγάλωσαν σε μήκος μεγαλύτερο από 6 πόδια. Αυτό τους καθιστά πιθανώς το μεγαλύτερο αρθρόποδο που έζησε ποτέ. Η συμπερίληψή τους στο υποφύλιο Cheilcerata κάνει αυτούς τους αρχαίους σκορπιούς καβούρι να συνδέονται στενότερα με τις αράχνες παρά με τα καβούρια.
