Η αναπαραγωγή των αμφιβίων έχει περισσότερα κοινά με αυτά των ψαριών από ό, τι των θηλαστικών ή ακόμη και των ερπετών. Ενώ όλα αυτά τα ζώα αναπαράγονται σεξουαλικά (που σημαίνει ότι το είδος αποτελείται από αρσενικά και θηλυκά και το ζευγάρωμα περιλαμβάνει τη γονιμοποίηση αυγά από σπέρμα), τα ερπετά και τα θηλαστικά αναπαράγονται μέσω εσωτερικής γονιμοποίησης (μέσα στη γυναίκα) ενώ τα αμφίβια ασκούν εξωτερικά γονιμοποίηση.
Το ζευγάρωμα για αμφίβια πρέπει σχεδόν πάντα να συμβαίνει στο γλυκό νερό. Αποτελείται από την ένωση του αρσενικού και του θηλυκού βατράχου, και αυτή τη στιγμή, το θηλυκό γεννά αυγά ενώ το αρσενικό απελευθερώνει σπέρμα. Τα γονιμοποιημένα αυγά αφήνονται πλέον μόνα και από τους δύο γονείς. Οι νέοι που εκκολάπτονται θα επιβιώσουν από μόνες τους.
Τα αμφίβια αυγά προστατεύονται από μια ουσία που μοιάζει με ζελέ πριν από την εκκόλαψη, σε αντίθεση με τα σκληρά ή ημίσκληρα κελύφη ερπετών και πουλιών.
Με εξαίρεση ορισμένα είδη βατράχων τροπικών δασών, τα αμφίβια δεν εκκολάπτονται σε μικροσκοπικά αντίγραφα των γονιών τους. Αντ 'αυτού, περνούν από ένα στάδιο ζωής ως γυρίνοι, που μοιάζουν με ψάρια και έχουν βράγχια και πτερύγια που αναπνέουν νερό. Αυτά τα χαρακτηριστικά τελικά θα χυθούν και θα αντικατασταθούν με πνεύμονες και πόδια που αναπνέουν αέρα καθώς ο γυρίνος εξελίσσεται σε νεαρό ενήλικα.