Klassificering af hver organisme, der bor på planeten, er en vigtig, men alligevel utrolig vanskelig opgave for biologer. På grund af det store udvalg af typer af levende organismer har videnskabsmanden skabt flere måder at identificere hver af dem på. Gennem disse processer kan der oprettes et mere organiseret system, bedre navngivning og mere nøjagtige familietræer.
Generel identifikation
Levende organismer på planeten er kategoriseret i seks kongeriger: dyr, planter, arkebakterier, eubakterier, svampe og protister. Hvert kongerige har forskellige fysiske og biologiske træk. Når man begynder at identificere en organisme, er det første skridt til yderligere at lokalisere den specifikke art at vide, hvilket kongerige den tilhører.
Dyr og planter identificeres let ved fysiske egenskaber, men archaebakterier og eubakterier identificeres ikke let, medmindre de undersøges under et mikroskop. Nogle svampe ligner planter, men en svamp kan ikke producere sin egen mad. Protister er derimod enhver levende ting, der ikke hører til de andre fem kongeriger.
Dikotom nøgle
En dikotom nøgle er et almindeligt værktøj, der bruges af biologer og andre naturforskere til at kategorisere en ukendt organisme. Denne "nøgle" er en række spørgsmål eller udsagn, der spørger om et specifikt kendetegn ved organismen. Når et spørgsmål er besvaret, fører det til et andet spørgsmål. Gennem denne række spørgsmål kan den ukendte organisme identificeres. Dikotome nøgler identificerer generelt store organismer, såsom planter og dyr, fordi deres egenskaber let kan ses med det blotte øje. Identifikation af mindre organismer kræver en mere videnskabelig tilgang.
Gramfarvning
Gramfarvning er den mest almindelige proces, der bruges til at identificere en bakteriel organisme. Bakterier er ekstremt små i størrelse, hvilket betyder at den eneste måde at identificere dem på er gennem et mikroskop. Gramfarvning er ideel til unge bakterieeksempler, fordi de farves lettere end fuldt udviklede. Gramfarvning virker ved at udsætte bakteriens cellevæg for to typer pletter: en violet og en rød. En bakterie med tykkere cellevægge er kendt som grampositive bakterier, fordi den bevarer den første plet og absorberer ikke den anden, mens en gramnegativ bakterie har en tyndere cellevæg og absorberer begge. Grampositive bakterier er violette, mens gramnegative bakterier er lyserøde.
Molekylær Biologi
Med stigningen i teknologi er biologer i stand til at studere de molekylære strukturer hos selv de mindste levende organismer og identificere hver organisme på en mere empirisk og videnskabelig måde. Molekylærbiologer studerer en bakteries DNA og sammenligner det med andet DNA for at se, om der er ligheder. Da DNA'et er en levende organisms "biologiske manual" og er unik for hver type organisme, kan det være meget specifikt og let at identificere det.