Proces produkce proteinu ze sekvence DNA - deoxyribonukleové kyseliny - zahrnuje dva hlavní kroky: transkripci a translaci. Během transkripce je z šablony DNA vytvořena poselská ribonukleová kyselina nebo mRNA. Tato mRNA se kombinuje s ribozomální RNA, známou jako rRNA, a přenosovou RNA nebo tRNA, komplexem k překladu mRNA kódu do aminokyselinové sekvence, proteinu. DNA je tvořena sekvencí nukleotidových bází. Čtyři báze jsou adenin, thymin, guanin a cytosin. Sekvence, ve které se tyto báze vyskytují na řetězci DNA, nakonec kóduje produkci určitých proteinů. Poté, co buňka vyrobí proteiny, mohou být použity strukturálně nebo v různých metabolických procesech.
Vytvořte přepis mRNA sekvence DNA. Každá báze v DNA odpovídá jiné bázi. Fotografie DNA to obvykle ukazují ve dvojité šroubovici, přičemž báze na jednom vlákně se spojují vazbami s komplementárními bázemi na opačném vlákně. Doplňkové báze jsou: adenin (A) a tymin (T) a cytosin (C) a guanin (G). Takže pokud jeden řetězec DNA čte A-C-G-C-T-A, pak komplementární řetězec je T-G-C-G-A-T. Sekvenci transkriptu mRNA najdete stejným způsobem pomocí doplňků bází uvedených v sekvenci DNA. RNA však neobsahuje bazický thymin (T); místo toho je tato báze nahrazena uracilem (U). Když narazíte na adenin (A) v sekvenci DNA, srovnejte jej s uracilem (U).
Pokud je sekvence DNA A-A-T-C-G-C-T-T-A-C-G-A, pak mRNA sekvence je U-U-A-G-C-G-A-A-U-G-C-U.
Vytvořte tRNA antikodonovou sekvenci z mRNA transkriptu. Každá tRNA má na sobě sadu tří bází známých jako antikodon. Antikodon odpovídá komplementárním bázím v sekvenci mRNA. Chcete-li určit celkovou antikodonovou sekvenci, která bude odpovídat řetězci mRNA, jednoduše přepište sekvenci RNA; jinými slovy, vypište doplňkové základy. Použitím dříve zaznamenané mRNA sekvence je tRNA anti-kodonová sekvence A-A-T-C-G-C -U-U-A-C-G-A.
Rozdělte nalezenou sekvenci tRNA na tři základní sady. Protože antikodony jsou složeny ze tří bází najednou, lepší způsob zápisu protikodonové sekvence A-A-T-C-G-C-U-U-A-C-G-A je AAT-CGC-UUA-CGA.
Tipy
-
Antikodonovou sekvenci najdete ještě rychleji pouhým napsáním DNA sekvence, přičemž U použijete pro uracil místo T pro thymin. Poté rozdělte sekvenci na tři základní antikodony.
Antikodonovou sekvenci můžete použít k porovnání s proteiny přidanými každou tRNA během translace, čímž vytvoříte aminokyselinovou sekvenci. Ověřte však, že referenční tabulka aminokyselin, kterou používáte, je pro antikodony, (viz Zdroje). Mnoho grafů sekvenování aminokyselin jednoduše uvádí seznam odpovídajících mRNA kodonů místo tRNA antikodonů, což vám umožňuje přeskočit krok stanovení antikodonové sekvence.
Sekvence molekuly tRNA je jednoduše transkripcí RNA sekvence DNA použité k jejímu vytvoření.