Структурата на двуверижната ДНК е универсална във всички живи клетки, но се наблюдават различия в методите за извличане на геномна ДНК от животински и растителни клетки. Въпреки че геномната ДНК живее в ядрото на клетките, количеството и чистотата на извлечената ДНК зависи от вида и размера на клетката. Например, определени клетки съдържат повече ДНК и примеси от други. Прочетете, за да научите повече за разликите в извличането на ДНК.
Обща екстракция на ДНК
Ако третирате растителни и животински клетки със сапунено вещество, това ще разгради липидите в клетъчните и ядрените мембрани. След това ДНК сместа ще се отдели от клетъчните мембрани и протеини. След това можете да използвате алкохол за утаяване на ДНК в разтвора. В зависимост от количеството в пробата, ДНК може да бъде видима с просто око. Имайте предвид обаче, че тази проста процедура не създава непременно ДНК с висока чистота.
Растителни и животински клетки
Растителните клетки се различават от животинските клетки поради тяхната твърда клетъчна стена и органели като хлоропласта. Те също така съдържат протеини и ензими, които играят роля при фотосинтезата. Някои растителни клетки имат полиплоидия, което означава, че имат повече от едно копие от всяка хромозома на клетка. В допълнение, клетъчните процеси, протичащи в растенията като фотосинтезата, произвеждат редица вторични метаболити. Животинските клетки нямат клетъчна стена, но въпреки това се нуждаят от химикали като натриев додецил сулфат (SDS), за да разрушат клетъчната мембрана, за да освободят геномна ДНК.
Екстракция на растителна ДНК
Растителната геномна ДНК е по-трудна за извличане поради клетъчната стена на растението. Можете да го премахнете чрез хомогенизиране или чрез добавяне на целулаза за разграждане на целулозата, която изгражда клетъчната стена. В допълнение, метаболитите, присъстващи в растителната клетка, могат да попречат на геномната екстракция на ДНК чрез замърсяване на ДНК пробата по време на процеса на утаяване.
Екстракция на ДНК на животни
Левкоцитите в периферната кръв са основният източник на геномна ДНК на животните, но събирането на проби е трудно, тъй като кръвта трябва да идва директно от животното. Кръвта съдържа набор от съединения като протеини, липиди, бели кръвни клетки, червени кръвни клетки, тромбоцити и плазма, които могат да замърсят ДНК пробата. Въпреки това, основният замърсител на ДНК на животни, извлечен от кръвни проби, е хемът, който е непротеиновият компонент на хемоглобина.
ДНК разликите
Разликите между растителната и животинската ДНК се крият в последователността на основите в спиралата. Съединенията, открити в растителните клетки, липсват в животинските клетки и ДНК базовите последователности отразяват това. Също така геномната растителна ДНК често е по-голяма от ДНК на животни. Тези разлики засягат също методите на екстракция, добива и чистотата на ДНК.